 
####################################################### 
#                                                     # 
#                        ACE                          # 
#                                                     # 
#        Ab-initio protein structure prediction       # 
#                         &                           # 
#               Comparative modeling                  # 
#                                                     # 
#                     Evaluator                       # 
#                                                     # 
#                ----------------- 11/1998            # 
#                                                     # 
#                         by                          # 
#           Adam Zemla & Ceslovas Venclovas           # 
#                                                     # 
#         Protein Structure Prediction Center         # 
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     # 
#                                                     # 
####################################################### 
########################## 
#                        # 
#    ACE parameters:     # 
#                        # 
########################## 
# 
# MEASURES: 
# 
# For AB: 0 3 9 13 14 
# For CM: 0 1 2 3 6 7 8 9 10 11 12 13 14 18 
# 
ARMSMC  0 1 2     7 8 9    11 12 13 14 18 
ARMSSC  0 1 2 3 6 7 8 9    11 12 13 14 18 
# 
CRMSCA  0 1 2     7 8 9 10 11 12 13 14 18 
CRMSMC  0 1 2     7 8 9 10 11 12 13 14 18 
CRMSSC  0 1 2 3 6     9    11 12 13 14 18 
CRMSALL 0 1 2     7 8 9    11 12 13 14 18 
# 
D-E_CA  0 1 2     7 8 9    11 12 13 14 18 
D-E_MC  0 1 2     7 8 9    11 12 13 14 18 
D-E_SC  0 1 2 3 6 7 8 9    11 12 13 14 18 
D-E_ALL 0 1 2     7 8 9    11 12 13 14 18 
# 
# Output parameters 
# 
DIHED-OUTPUT        0         #    1 - ON, 0 - OFF 
RES-CONTACTS        0         #    1 - ON, 0 - OFF 
SS-OUTPUT           1         #    1 - ON, 0 - OFF 
PHI-PSI             0         #    1 - SEPARATELY, 0 - NO  
# 
# Calculation parameters 
# 
SOV-METHOD          1         #    0 - SOV 94,  1 - SOV 
# 
TEMP-FACTOR         30.0      #    Target structure temperature factor cutoff 
ACCESS-CUTOFF       0.20      #    Solvent accessibility cutoff   
ANGLES-CORRECT      30.0      #    target-model  (diff < 30.0)    
DSSP-HELIX          6         #    Secondary Structure subset: helix cutoff  
DSSP-STRAND         3         #    Secondary Structure subset: strand cutoff 
ROTAMERS-LIMIT      30.0      #    target-parent (diff > 30.0) 
ROTATION-MATRIX     0         #    1 - ON, 0 - OFF   
SC-SWAPPING         1         #    1 - ON, 0 - OFF    
SEP-CONTACTS        1         #    Separation interval along the chain 
RESIDUE-CONTACTS    8.0       #    Contact definition between two C-beta atoms 
# 
CRMS-METHOD         1         #    0 - ALL, 1 - CA, 2 - MC+CB, 3 - CA (iter)  
ITER-CUTOFF         2.5       #    DISTANCE cutoff (for CA (iter))  
LCS_GDT             1         #    LCS and GDT calculations (1 - ON, 0 - OFF) 
########################## 
#                        # 
#      ACE results:      # 
#                        # 
########################## 
 
 
 
#          The number of residues in SS section: 152 , MODEL 152 , TARGET 158 
#          The number of residues possible to evaluate: 152 
 
 
 SECONDARY STRUCTURE PREDICTION: 
       NUM    RES   SS   Prediction   Probability 
 SSP     3     A     E     C             1.00 
 SSP     4     S     C     C             1.00 
 SSP     5     S     C     C             1.00 
 SSP     6     T     C     C             1.00 
 SSP     7     R     C     C             1.00 
 SSP     8     G     C     C             1.00 
 SSP     9     N     C     C             1.00 
 SSP    10     L     C     C             1.00 
 SSP    11     D     C     C             1.00 
 SSP    12     V     H     H             1.00 
 SSP    13     A     H     H             1.00 
 SSP    14     K     H     H             1.00 
 SSP    15     L     H     H             1.00 
 SSP    16     N     C     C             1.00 
 SSP    17     G     E     E             1.00 
 SSP    18     D     E     E             1.00 
 SSP    19     W     C     C             1.00 
 SSP    20     F     E     C             1.00 
 SSP    21     S     E     E             1.00 
 SSP    22     I     E     E             1.00 
 SSP    23     V     E     E             1.00 
 SSP    24     V     E     E             1.00 
 SSP    25     A     E     E             1.00 
 SSP    26     S     C     E             1.00 
 SSP    27     N     C     C             1.00 
 SSP    28     K     C     C             1.00 
 SSP    29     R     H     H             1.00 
 SSP    30     E     H     H             1.00 
 SSP    31     K     H     H             1.00 
 SSP    32     I     C     H             1.00 
 SSP    33     E     C     C             1.00 
 SSP    34     E     C     C             1.00 
 SSP    35     N     C     C             1.00 
 SSP    36     G     C     C             1.00 
 SSP    37     S     C     C             1.00 
 SSP    38     M     C     C             1.00 
 SSP    39     R     C     C             1.00 
 SSP    40     V     C     C             1.00 
 SSP    41     F     E     E             1.00 
 SSP    42     M     E     E             1.00 
 SSP    43     Q     E     E             1.00 
 SSP    44     H     E     E             1.00 
 SSP    45     I     E     E             1.00 
 SSP    46     D     E     E             1.00 
 SSP    47     V     E     E             1.00 
 SSP    48     L     E     C             1.00 
 SSP    49     E     C     C             1.00 
 SSP    50     N     C     C             1.00 
 SSP    51     S     E     E             1.00 
 SSP    52     L     E     E             1.00 
 SSP    53     G     E     E             1.00 
 SSP    54     F     E     E             1.00 
 SSP    55     K     E     E             1.00 
 SSP    56     F     E     E             1.00 
 SSP    57     R     E     E             1.00 
 SSP    58     I     E     E             1.00 
 SSP    59     K     E     E             1.00 
 SSP    60     E     C     E             1.00 
 SSP    61     N     C     C             1.00 
 SSP    62     G     C     C             1.00 
 SSP    63     E     C     E             1.00 
 SSP    64     C     E     E             1.00 
 SSP    65     R     E     E             1.00 
 SSP    66     E     E     E             1.00 
 SSP    67     L     E     E             1.00 
 SSP    68     Y     E     E             1.00 
 SSP    69     L     E     E             1.00 
 SSP    70     V     E     E             1.00 
 SSP    71     A     E     E             1.00 
 SSP    72     Y     E     E             1.00 
 SSP    73     K     E     E             1.00 
 SSP    74     T     C     C             1.00 
 SSP    75     P     C     C             1.00 
 SSP    76     E     C     C             1.00 
 SSP    77     D     C     C             1.00 
 SSP    78     G     C     C             1.00 
 SSP    79     E     C     C             1.00 
 SSP    80     Y     E     E             1.00 
 SSP    81     F     E     E             1.00 
 SSP    82     V     E     E             1.00 
 SSP    83     E     E     E             1.00 
 SSP    84     Y     C     C             1.00 
 SSP    85     D     C     C             1.00 
 SSP    86     G     C     C             1.00 
 SSP    87     G     E     E             1.00 
 SSP    88     N     E     E             1.00 
 SSP    89     T     E     E             1.00 
 SSP    90     F     E     E             1.00 
 SSP    91     T     E     E             1.00 
 SSP    92     I     E     E             1.00 
 SSP    93     L     E     E             1.00 
 SSP    94     K     E     E             1.00 
 SSP    95     T     E     E             1.00 
 SSP    96     D     C     C             1.00 
 SSP    97     Y     C     C             1.00 
 SSP    98     D     C     C             1.00 
 SSP    99     R     C     C             1.00 
 SSP   100     Y     E     E             1.00 
 SSP   101     V     E     E             1.00 
 SSP   102     M     E     E             1.00 
 SSP   103     F     E     E             1.00 
 SSP   104     H     E     E             1.00 
 SSP   105     L     E     E             1.00 
 SSP   106     I     E     E             1.00 
 SSP   107     N     E     E             1.00 
 SSP   108     F     E     E             1.00 
 SSP   109     K     E     E             1.00 
 SSP   110     N     C     C             1.00 
 SSP   111     G     C     C             1.00 
 SSP   112     E     E     E             1.00 
 SSP   113     T     E     E             1.00 
 SSP   114     F     E     E             1.00 
 SSP   115     Q     E     E             1.00 
 SSP   116     L     E     E             1.00 
 SSP   117     M     E     E             1.00 
 SSP   118     V     E     E             1.00 
 SSP   119     L     E     E             1.00 
 SSP   120     Y     E     E             1.00 
 SSP   121     G     E     E             1.00 
 SSP   122     R     C     C             1.00 
 SSP   123     T     C     C             1.00 
 SSP   124     K     C     C             1.00 
 SSP   125     D     C     C             1.00 
 SSP   126     L     C     C             1.00 
 SSP   127     S     C     C             1.00 
 SSP   128     S     H     H             1.00 
 SSP   129     D     H     H             1.00 
 SSP   130     I     H     H             1.00 
 SSP   131     K     H     H             1.00 
 SSP   132     E     H     H             1.00 
 SSP   133     K     H     H             1.00 
 SSP   134     F     H     H             1.00 
 SSP   135     A     H     H             1.00 
 SSP   136     K     H     H             1.00 
 SSP   137     L     H     H             1.00 
 SSP   138     C     H     H             1.00 
 SSP   139     E     H     H             1.00 
 SSP   140     A     C     C             1.00 
 SSP   141     H     C     C             1.00 
 SSP   142     G     C     C             1.00 
 SSP   143     I     C     C             1.00 
 SSP   144     T     C     C             1.00 
 SSP   145     R     H     C             1.00 
 SSP   146     D     H     C             1.00 
 SSP   147     N     H     C             1.00 
 SSP   148     I     E     E             1.00 
 SSP   149     I     E     E             1.00 
 SSP   150     D     E     E             1.00 
 SSP   151     L     H     C             1.00 
 SSP   152     T     H     C             1.00 
 SSP  BREAK 
 SSP   157     C     C     C             1.00 
 SSP   158     L     C     C             1.00 
 
 NP      - Number of predicted residues 
 PP      - Percent of predicted residues 
 Q3      - Residues predicted correctly (H, E, C) 
 Qhelix  - Residues predicted correctly (HELIX) 
 Qstrand - Residues predicted correctly (STRAND) 
 Qcoil   - Residues predicted correctly (COIL) 
 SOV     - Segment overlap quantity 
 
                     Q3      Qhelix   Qstrand   Qcoil      PP 
 Qindex              92.1      79.2     95.8     92.9     96.2 
 
                     ALL      HELIX    STRAND    COIL      PP 
 SOV observed        94.7      79.2     98.6     96.2     96.2 
 
           Considered    Percent predicted   Percent predicted 
            segments        correctly         as wrong type 
 SEG           15              86.7               0.0 
 
         Number of wrong    Number of wrong 
             breaks             joins 
 B/J            0                 0 
 
  CONFIDENCE (P)     Average     NP    PP/BIN     Q3 
 BIN  0.90 - 1.00      1.00     152    100.0     92.1 
 
 BIN  0.00 - 1.00      1.00     152    100.0     92.1 
 
 
 
 
              predicted        number of target      total number   total number 
                as a         contacts possible in         of             of 
               contact         predicted subset:       contacts       contacts 
            percent  number    percent    number       in target    in prediction 
 CONTACTS:     0.0      0         0.0        0             0              0 
 
 
# WARNING! The number of residues with CB atom coordinates: MODEL 0 , TARGET 147 
 
# WARNING! TARGET 1287 atoms, MODEL 685 atoms, 661 common with TARGET 
           Number of atoms possible to evaluate: 608 
 
MEASURES: 
 
 
ANGLES RMS : model <-> target 
 
 (MC: PHI+PSI) DIHED RMS:      ARMSMC            PC     NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    29.77           90.0   300    95.5   314     ARMSMC  
     SECONDARY STRUCTURE . .    15.81           95.1   162   100.0   162     ARMSMC  
     SURFACE . . . . . . . .    38.61           85.2   155    94.5   164     ARMSMC  
     BURIED  . . . . . . . .    15.49           95.2   145    96.7   150     ARMSMC  
 (SC: CHI1) DIHED RMS:         ARMSSC            PC     NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0   141     ARMSSC1 
     RELIABLE SIDE CHAINS  .     0.00            0.0     0     0.0   132     ARMSSC1 
     SECONDARY STRUCTURE . .     0.00            0.0     0     0.0    75     ARMSSC1 
     SURFACE . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    77     ARMSSC1 
     BURIED  . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    64     ARMSSC1 
 (SC: CHI2) DIHED RMS:         ARMSSC            PC     NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0   111     ARMSSC2 
     RELIABLE SIDE CHAINS  .     0.00            0.0     0     0.0    84     ARMSSC2 
     SECONDARY STRUCTURE . .     0.00            0.0     0     0.0    59     ARMSSC2 
     SURFACE . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    64     ARMSSC2 
     BURIED  . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    47     ARMSSC2 
 (SC: CHI3) DIHED RMS:         ARMSSC            PC     NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    43     ARMSSC3 
     RELIABLE SIDE CHAINS  .     0.00            0.0     0     0.0    41     ARMSSC3 
     SECONDARY STRUCTURE . .     0.00            0.0     0     0.0    20     ARMSSC3 
     SURFACE . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    33     ARMSSC3 
     BURIED  . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    10     ARMSSC3 
 (SC: CHI4) DIHED RMS:         ARMSSC            PC     NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    22     ARMSSC4 
     RELIABLE SIDE CHAINS  .     0.00            0.0     0     0.0    22     ARMSSC4 
     SECONDARY STRUCTURE . .     0.00            0.0     0     0.0    10     ARMSSC4 
     SURFACE . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    17     ARMSSC4 
     BURIED  . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0     5     ARMSSC4 
 
COORDINATES RMS : model <-> target 
 
 
LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT (Longest continuous sequence under CA RMS cutoff   5.00): 
 FRAGMENT  1    3 - 152  150  Length     Seq        L_RMS   ALL_CA_RMS 
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT   150      3 - 152      1.11     1.11 
  LCS LOCAL_SCORE:            100.00 
 
 
LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT (Longest continuous sequence under CA RMS cutoff   2.00): 
 FRAGMENT  1    3 - 152  150  Length     Seq        L_RMS   ALL_CA_RMS 
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT   150      3 - 152      1.11     1.11 
  LCS LOCAL_SCORE:            100.00 
 
 
LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT (Longest continuous sequence under CA RMS cutoff   1.00): 
 FRAGMENT  1    3 - 152  150  Length     Seq        L_RMS   ALL_CA_RMS 
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT    91     62 - 152      0.93     1.12 
  LCS LOCAL_SCORE:             51.57 
 
 
 LCS                   LENGTH_OF_THE 
 LCS  RESIDUE  RESIDUE    CONTINUOUS  SECONDARY 
 LCS   NUMBER     NAME       SEGMENT  STRUCTURE   GDT_DATA_COLUMNS (PERCENT OF THE TARGET) 
 LCS       3       A    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS       4       S    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS       5       S    57  150  150       C       31  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS       6       T    57  150  150       C        8  37  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS       7       R    57  150  150       C        6  19  63  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS       8       G    57  150  150       C        3   9  38  89  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS       9       N    57  150  150       C        8  48  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      10       L    57  150  150       C       10  81  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      11       D    57  150  150       C       51  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      12       V    57  150  150       H       54  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      13       A    57  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      14       K    57  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      15       L    57  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      16       N    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      17       G    57  150  150       E       53  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      18       D    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      19       W    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      20       F    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      21       S    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      22       I    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      23       V    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      24       V    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      25       A    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      26       S    57  150  150       C       54  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      27       N    57  150  150       C        6  68  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      28       K    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      29       R    57  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      30       E    57  150  150       H       51  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      31       K    57  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      32       I    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      33       E    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      34       E    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      35       N    57  150  150       C       43  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      36       G    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      37       S    57  150  150       C       54  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      38       M    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      39       R    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      40       V    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      41       F    57  150  150       E       52  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      42       M    57  150  150       E       48  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      43       Q    57  150  150       E       48  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      44       H    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      45       I    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      46       D    57  150  150       E       46  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      47       V    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      48       L    57  150  150       E       48  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      49       E    57  150  150       C       35  81  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      50       N    57  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      51       S    57  150  150       E       40  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      52       L    57  150  150       E       44  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      53       G    57  150  150       E       54  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      54       F    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      55       K    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      56       F    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      57       R    57  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      58       I    57  150  150       E       54  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      59       K    57  150  150       E       13  62  87  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      60       E    53  150  150       C        4   6  15  65  90  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      61       N    21  150  150       C        4   6  14  24  41  64  93  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      62       G    91  150  150       C        4   8  15  27  70  91  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      63       E    91  150  150       C        4  21  74  89  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      64       C    91  150  150       E       11  78  87  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      65       R    91  150  150       E       36  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      66       E    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      67       L    91  150  150       E       44  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      68       Y    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      69       L    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      70       V    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      71       A    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      72       Y    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      73       K    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      74       T    91  150  150       C       38  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      75       P    91  150  150       C       34  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      76       E    91  150  150       C       21  81  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      77       D    91  150  150       C        6  44  86  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      78       G    91  150  150       C       11  58  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      79       E    91  150  150       C       10  77  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      80       Y    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      81       F    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      82       V    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      83       E    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      84       Y    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      85       D    91  150  150       C       49  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      86       G    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      87       G    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      88       N    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      89       T    91  150  150       E       27  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      90       F    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      91       T    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      92       I    91  150  150       E       45  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      93       L    91  150  150       E       27  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      94       K    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      95       T    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      96       D    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      97       Y    91  150  150       C       50  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      98       D    91  150  150       C       51  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS      99       R    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     100       Y    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     101       V    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     102       M    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     103       F    91  150  150       E       53  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     104       H    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     105       L    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     106       I    91  150  150       E       55  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     107       N    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     108       F    91  150  150       E       45  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     109       K    91  150  150       E       43  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     110       N    91  150  150       C       44  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     111       G    91  150  150       C       44  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     112       E    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     113       T    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     114       F    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     115       Q    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     116       L    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     117       M    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     118       V    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     119       L    91  150  150       E       51  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     120       Y    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     121       G    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     122       R    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     123       T    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     124       K    91  150  150       C       27  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     125       D    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     126       L    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     127       S    91  150  150       C       43  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     128       S    91  150  150       H       42  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     129       D    91  150  150       H       51  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     130       I    91  150  150       H       51  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     131       K    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     132       E    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     133       K    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     134       F    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     135       A    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     136       K    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     137       L    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     138       C    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     139       E    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     140       A    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     141       H    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     142       G    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     143       I    91  150  150       C       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     144       T    91  150  150       C       48  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     145       R    91  150  150       H       45  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     146       D    91  150  150       H       54  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     147       N    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     148       I    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     149       I    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     150       D    91  150  150       E       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     151       L    91  150  150       H       56  83  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     152       T    91  150  150       H       13  78  89  91  92  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     153       K     0    0    0       H        0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  
 LCS     154       T     0    0    0       C        0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  
 LCS     155       D     0    0    0       C        0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  
 LCS     156       R     0    0    0       C        0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0   0  
 LCS     157       C     0    0    0       C        0   0   0   0   0  11  22  89  94  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS     158       L     0    0    0       C        0   7  16  89  91  93  94  94  95  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  96  
 LCS TOTAL_SCORE (RMS CUTOFF   1.00):  46.48 
 
 NUMBER_OF_CA_Tg:  158      NUMBER_OF_CA_Pr:  152      PERCENT_OF_CA:  96.20  
 
GLOBAL_DISTANCE_TEST (the largest set of residues under DISTANCE_CUTOFF (using LCS results)): 
 GDT DISTANCE_CUTOFF     0.50    1.00    1.50    2.00    2.50    3.00    3.50    4.00    4.50    5.00    5.50    6.00    6.50    7.00    7.50    8.00    8.50    9.00    9.50   10.00  
 GDT NUMBER_OF_CA_max      89     132     141     144     146     148     149     150     151     152     152     152     152     152     152     152     152     152     152     152  
 GDT PERCENT_OF_CA_Pr   58.55   86.84   92.76   94.74   96.05   97.37   98.03   98.68   99.34  100.00  100.00  100.00  100.00  100.00  100.00  100.00  100.00  100.00  100.00  100.00 
 GDT PERCENT_OF_CA_Tg   56.33   83.54   89.24   91.14   92.41   93.67   94.30   94.94   95.57   96.20   96.20   96.20   96.20   96.20   96.20   96.20   96.20   96.20   96.20   96.20 
 GDT FRAGMENT: Beg-End   3-151   3-151   3-152   3-152   3-152   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158   3-158 
 GDT RMS_LOCAL           0.34    0.50    0.64    0.71    0.77    0.88    0.91    1.01    1.13    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20 
 GDT RMS_ALL_CA          1.27    1.27    1.26    1.26    1.25    1.22    1.22    1.21    1.21    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20    1.20 
 
 
 TEST (CA)  RMS =   1.20               (Number of atoms:  152) 
 
 (CA)  RMS:                   CRMSCA         NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    1.20        152    96.2   158     CRMSCA  
     CRN = ALL/NP  . . . . .    0.0079                            CRMSCA  
     SECONDARY STRUCTURE . .    0.63         81   100.0    81     CRMSCA  
     SURFACE . . . . . . . .    1.44         78    94.0    83     CRMSCA  
     BURIED  . . . . . . . .    0.89         74    98.7    75     CRMSCA  
 (MC)  RMS:                   CRMSMC         NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    1.22        608    78.0   779     CRMSMC  
     SECONDARY STRUCTURE . .    0.68        324    80.6   402     CRMSMC  
     SURFACE . . . . . . . .    1.46        312    75.9   411     CRMSMC  
     BURIED  . . . . . . . .    0.90        296    80.4   368     CRMSMC  
 (SC)  RMS:                   CRMSSC         NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    0.00          0     0.0   655     CRMSSC  
     RELIABLE SIDE CHAINS  .    0.00          0     0.0   573     CRMSSC  
     SECONDARY STRUCTURE . .    0.00          0     0.0   357     CRMSSC  
     SURFACE . . . . . . . .    0.00          0     0.0   360     CRMSSC  
     BURIED  . . . . . . . .    0.00          0     0.0   295     CRMSSC  
 (ALL) RMS:                   CRMSALL        NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    1.22        608    47.2  1287     CRMSALL 
     SECONDARY STRUCTURE . .    0.68        324    47.6   681     CRMSALL 
     SURFACE . . . . . . . .    1.46        312    45.1   692     CRMSALL 
     BURIED  . . . . . . . .    0.90        296    49.7   595     CRMSALL 
 
Accuracy of estimates of atomic coordinate errors: model <-> target 
 
 (CA)  ERRORS:                  |D-E|   |D-E|/|D+E|   SR(D,E)    NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    0.829      1.000       0.500    152    96.2   158     ERRCA  
     SECONDARY STRUCTURE . .    0.567      1.000       0.500     81   100.0    81     ERRCA  
     SURFACE . . . . . . . .    1.009      1.000       0.500     78    94.0    83     ERRCA  
     BURIED  . . . . . . . .    0.640      1.000       0.500     74    98.7    75     ERRCA  
 (MC)  ERRORS:                  |D-E|   |D-E|/|D+E|   SR(D,E)    NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    0.853      1.000       0.500    608    78.0   779     ERRMC  
     SECONDARY STRUCTURE . .    0.595      1.000       0.500    324    80.6   402     ERRMC  
     SURFACE . . . . . . . .    1.026      1.000       0.500    312    75.9   411     ERRMC  
     BURIED  . . . . . . . .    0.672      1.000       0.500    296    80.4   368     ERRMC  
 (SC)  ERRORS:                  |D-E|   |D-E|/|D+E|   SR(D,E)    NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    0.000      0.000       0.000      0     0.0   655     ERRSC  
     RELIABLE SIDE CHAINS  .    0.000      0.000       0.000      0     0.0   573     ERRSC  
     SECONDARY STRUCTURE . .    0.000      0.000       0.000      0     0.0   357     ERRSC  
     SURFACE . . . . . . . .    0.000      0.000       0.000      0     0.0   360     ERRSC  
     BURIED  . . . . . . . .    0.000      0.000       0.000      0     0.0   295     ERRSC  
 (ALL) ERRORS:                  |D-E|   |D-E|/|D+E|   SR(D,E)    NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    0.853      1.000       0.500    608    47.2  1287     ERRALL 
     SECONDARY STRUCTURE . .    0.595      1.000       0.500    324    47.6   681     ERRALL 
     SURFACE . . . . . . . .    1.026      1.000       0.500    312    45.1   692     ERRALL 
     BURIED  . . . . . . . .    0.672      1.000       0.500    296    49.7   595     ERRALL 
 
 
 
DISTANCES: Percent of total atoms where distance (target <-> model) in global 
           superposition is less than: 1 , 2 , 3 , 5 , 10 Angstroms 
            D < 1     D < 2     D < 3     D < 5    D < 10      NP      TN 
CA  (N)       123       143       147       149       152     152     158   DISTCA 
CA  (P)     77.85     90.51     93.04     94.30     96.20             158   DISTCA 
CA  (RMS)    0.59      0.74      0.85      0.93      1.20                   DISTCA 
 
ALL (N)       494       565       584       600       608     608    1287   DISTALL 
ALL (P)     38.38     43.90     45.38     46.62     47.24            1287   DISTALL 
ALL (RMS)    0.59      0.73      0.85      1.06      1.22                   DISTALL 
 
 
 
 
END of the results output 
