####################################################### # # # LGA # # --------------- # # # # Local-Global Alignment # # A Method for Finding 3-D Similarities # # in Protein Structures # # # # ------------ 09/2019 # # # # Adam Zemla (zemla1@llnl.gov) # # Lawrence Livermore National Laboratory, CA # # # ####################################################### # Molecule1: number of CA atoms 136 ( 1097), selected 135 , name T1228v2TS304_4-D2 # Molecule2: number of CA atoms 135 ( 2219), selected 135 , name T1228v2-D2.pdb # PARAMETERS: -3 -ie -o1 -sda -d:4 -gdc_sc -swap T1228v2TS304_4-D2.lga # FIXED Atom-Atom correspondence # GDT and LCS analysis LCS - RMSD CUTOFF 5.00 length segment l_RMS g_RMS LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT: 135 165 - 300 0.92 0.92 LCS_AVERAGE: 100.00 LCS - RMSD CUTOFF 2.00 length segment l_RMS g_RMS LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT: 135 165 - 300 0.92 0.92 LCS_AVERAGE: 100.00 LCS - RMSD CUTOFF 1.00 length segment l_RMS g_RMS LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT: 135 165 - 300 0.92 0.92 LCS_AVERAGE: 100.00 LCS_GDT MOLECULE-1 MOLECULE-2 LCS_DETAILS GDT_DETAILS TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS: 135 LCS_GDT RESIDUE RESIDUE SEGMENT_SIZE GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair LCS_GDT NAME NUMBER NAME NUMBER 1.0 2.0 5.0 0.5 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0 3.5 4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5 7.0 7.5 8.0 8.5 9.0 9.5 10.0 LCS_GDT G 165 G 165 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 166 K 166 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT W 167 W 167 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT I 168 I 168 135 135 135 76 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT S 169 S 169 135 135 135 17 104 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT G 170 G 170 135 135 135 5 96 121 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT L 171 L 171 135 135 135 58 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT A 172 A 172 135 135 135 81 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT P 173 P 173 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Y 174 Y 174 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT G 175 G 175 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Y 176 Y 176 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Q 177 Q 177 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT L 178 L 178 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT N 179 N 179 135 135 135 11 109 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 180 K 180 135 135 135 3 20 38 83 101 130 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 181 K 181 135 135 135 5 108 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT T 182 T 182 135 135 135 45 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT S 183 S 183 135 135 135 78 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 184 K 184 135 135 135 78 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT L 185 L 185 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT D 186 D 186 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT P 187 P 187 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT V 188 V 188 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT E 189 E 189 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT D 190 D 190 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT E 191 E 191 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT A 192 A 192 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 193 K 193 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT V 194 V 194 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT V 195 V 195 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Q 196 Q 196 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT L 197 L 197 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 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135 135 135 135 LCS_GDT F 289 F 289 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Q 290 Q 290 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Q 291 Q 291 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT S 292 S 292 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Q 293 Q 293 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT V 294 V 294 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 295 K 295 135 135 135 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT I 296 I 296 135 135 135 75 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT A 297 A 297 135 135 135 57 113 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT N 298 N 298 135 135 135 60 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 299 K 299 135 135 135 3 4 30 120 128 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT V 300 V 300 135 135 135 3 72 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_AVERAGE LCS_A: 100.00 ( 100.00 100.00 100.00 ) GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds) GDT DIST_CUTOFF 0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00 3.50 4.00 4.50 5.00 5.50 6.00 6.50 7.00 7.50 8.00 8.50 9.00 9.50 10.00 GDT NUMBER_AT 85 115 126 130 132 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 GDT PERCENT_AT 62.96 85.19 93.33 96.30 97.78 99.26 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 GDT RMS_LOCAL 0.29 0.47 0.62 0.72 0.77 0.85 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 GDT RMS_ALL_AT 0.95 0.94 0.93 0.93 0.93 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 0.92 # Checking swapping # possible swapping detected: Y 174 Y 174 # possible swapping detected: E 189 E 189 # possible swapping detected: E 191 E 191 # possible swapping detected: F 199 F 199 # possible swapping detected: F 202 F 202 # possible swapping detected: Y 211 Y 211 # possible swapping detected: E 258 E 258 # possible swapping detected: E 270 E 270 # possible swapping detected: E 272 E 272 # possible swapping detected: D 285 D 285 # possible swapping detected: E 287 E 287 # possible swapping detected: F 289 F 289 # Molecule1 Molecule2 DISTANCE Mis MC All Dist_max GDC_mc GDC_all Dist_at LGA G 165 G 165 0.555 0 0.034 0.034 0.600 86.364 86.364 - LGA K 166 K 166 0.403 0 0.041 0.158 1.080 100.000 92.121 1.080 LGA W 167 W 167 0.331 0 0.196 0.233 0.536 100.000 96.104 0.520 LGA I 168 I 168 0.841 0 0.175 1.564 3.437 81.818 64.318 2.260 LGA S 169 S 169 1.335 0 0.585 0.624 2.864 55.909 54.242 1.959 LGA G 170 G 170 1.773 0 0.039 0.039 1.932 58.182 58.182 - LGA L 171 L 171 1.074 0 0.046 1.398 5.702 65.455 45.455 3.023 LGA A 172 A 172 0.627 0 0.011 0.024 0.820 86.364 85.455 - LGA P 173 P 173 0.230 0 0.013 0.231 0.577 100.000 97.403 0.577 LGA Y 174 Y 174 0.360 0 0.011 0.228 1.393 100.000 86.667 1.393 LGA G 175 G 175 0.206 0 0.059 0.059 0.237 100.000 100.000 - LGA Y 176 Y 176 0.225 0 0.008 0.161 0.474 100.000 100.000 0.199 LGA Q 177 Q 177 0.488 0 0.059 0.269 1.007 95.455 90.101 0.677 LGA L 178 L 178 0.381 0 0.132 0.200 1.786 90.909 82.500 1.786 LGA N 179 N 179 1.229 0 0.169 0.636 4.722 59.091 35.909 4.722 LGA K 180 K 180 4.137 0 0.282 0.965 13.730 16.364 7.273 13.730 LGA K 181 K 181 1.573 0 0.465 0.959 10.065 65.909 30.707 10.065 LGA T 182 T 182 0.875 0 0.034 1.115 3.565 77.727 64.935 3.565 LGA S 183 S 183 0.811 0 0.104 0.093 1.167 82.273 76.667 1.049 LGA K 184 K 184 0.897 0 0.073 0.861 2.789 77.727 70.303 2.789 LGA L 185 L 185 0.441 0 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0.109 0 0.012 0.041 0.161 100.000 100.000 0.094 LGA F 202 F 202 0.129 0 0.000 0.012 0.226 100.000 100.000 0.219 LGA L 203 L 203 0.291 0 0.018 0.049 0.665 100.000 95.455 0.614 LGA N 204 N 204 0.365 0 0.015 0.095 1.197 100.000 88.864 0.964 LGA G 205 G 205 0.303 0 0.040 0.040 0.421 100.000 100.000 - LGA L 206 L 206 0.428 0 0.014 0.135 0.707 90.909 93.182 0.352 LGA N 207 N 207 0.865 0 0.000 0.181 1.462 81.818 75.682 1.062 LGA G 208 G 208 0.957 0 0.104 0.104 1.392 73.636 73.636 - LGA K 209 K 209 1.101 0 0.055 0.201 2.899 69.545 56.768 2.899 LGA D 210 D 210 1.017 0 0.109 0.498 1.387 73.636 80.227 1.387 LGA Y 211 Y 211 1.809 0 0.123 0.607 2.088 54.545 50.000 1.743 LGA S 212 S 212 2.321 0 0.640 0.785 6.018 36.364 26.061 6.018 LGA Y 213 Y 213 3.000 0 0.166 1.093 14.414 41.818 14.091 14.414 LGA A 215 A 215 1.084 0 0.199 0.216 2.030 82.273 73.455 - LGA I 216 I 216 0.420 0 0.000 0.146 0.498 100.000 100.000 0.476 LGA A 217 A 217 0.327 0 0.046 0.059 0.369 100.000 100.000 - LGA S 218 S 218 0.518 0 0.025 0.108 1.189 90.909 85.152 1.189 LGA H 219 H 219 0.415 0 0.012 0.093 0.730 100.000 92.727 0.730 LGA L 220 L 220 0.326 0 0.000 0.082 0.456 100.000 100.000 0.456 LGA T 221 T 221 0.306 0 0.000 0.018 0.349 100.000 100.000 0.243 LGA N 222 N 222 0.359 0 0.042 0.060 0.506 100.000 97.727 0.506 LGA L 223 L 223 0.552 0 0.035 0.065 0.755 86.364 84.091 0.700 LGA Q 224 Q 224 0.582 0 0.036 0.211 0.996 90.909 85.859 0.887 LGA I 225 I 225 0.500 0 0.047 0.102 0.532 86.364 90.909 0.220 LGA P 226 P 226 0.534 0 0.033 0.060 0.739 81.818 81.818 0.739 LGA T 227 T 227 0.482 0 0.039 0.079 0.678 95.455 94.805 0.678 LGA P 228 P 228 0.534 0 0.087 0.094 0.534 86.364 89.610 0.468 LGA S 229 S 229 0.715 0 0.145 0.152 0.924 81.818 84.848 0.437 LGA G 230 G 230 0.838 0 0.058 0.058 1.114 77.727 77.727 - LGA K 231 K 231 0.328 0 0.037 0.499 1.196 100.000 92.121 1.196 LGA K 232 K 232 0.324 0 0.080 0.269 1.126 95.455 92.121 1.126 LGA R 233 R 233 0.202 0 0.035 1.097 5.526 100.000 54.876 3.600 LGA W 234 W 234 0.255 0 0.031 0.128 0.631 100.000 93.506 0.603 LGA N 235 N 235 0.506 0 0.010 0.549 2.405 95.455 81.136 2.405 LGA Q 236 Q 236 0.501 0 0.000 0.907 3.587 86.364 65.051 3.587 LGA Y 237 Y 237 0.634 0 0.058 0.177 1.006 81.818 80.455 0.977 LGA T 238 T 238 0.368 0 0.007 0.037 0.413 100.000 100.000 0.367 LGA I 239 I 239 0.268 0 0.020 0.106 0.347 100.000 100.000 0.347 LGA K 240 K 240 0.587 0 0.029 0.203 2.696 86.364 67.677 2.696 LGA A 241 A 241 0.463 0 0.083 0.088 0.612 90.909 92.727 - LGA I 242 I 242 0.045 0 0.044 0.071 0.265 100.000 100.000 0.144 LGA L 243 L 243 0.209 0 0.037 0.055 0.489 100.000 100.000 0.271 LGA Q 244 Q 244 0.240 0 0.043 0.235 0.787 95.455 93.939 0.650 LGA N 245 N 245 0.229 0 0.020 0.086 0.535 100.000 97.727 0.535 LGA E 246 E 246 0.243 0 0.023 0.483 1.485 100.000 94.141 0.875 LGA V 247 V 247 0.230 0 0.000 0.037 0.305 100.000 100.000 0.276 LGA Y 248 Y 248 0.290 0 0.034 0.126 1.090 100.000 91.061 1.090 LGA I 249 I 249 0.198 0 0.022 0.025 0.317 100.000 100.000 0.250 LGA G 250 G 250 0.167 0 0.048 0.048 0.273 100.000 100.000 - LGA T 251 T 251 0.183 0 0.032 0.037 0.322 100.000 100.000 0.204 LGA V 252 V 252 0.318 0 0.053 0.110 0.575 100.000 97.403 0.575 LGA K 253 K 253 0.575 0 0.064 0.145 0.867 90.909 85.859 0.779 LGA Y 254 Y 254 0.651 0 0.029 0.211 2.089 86.364 67.727 2.089 LGA K 255 K 255 0.694 0 0.011 0.157 1.593 81.818 74.747 1.593 LGA V 256 V 256 0.737 0 0.052 0.062 0.783 81.818 81.818 0.722 LGA R 257 R 257 0.894 0 0.099 1.071 5.510 77.727 51.405 3.151 LGA E 258 E 258 1.106 0 0.055 0.322 2.011 65.455 59.192 2.011 LGA K 259 K 259 1.707 0 0.045 0.229 2.107 54.545 49.697 1.854 LGA T 260 T 260 1.710 0 0.012 0.096 2.168 47.727 49.091 1.587 LGA K 261 K 261 2.428 0 0.022 0.291 4.068 35.455 27.475 4.068 LGA D 262 D 262 2.167 0 0.027 0.483 2.784 38.182 37.045 2.505 LGA G 263 G 263 2.279 0 0.000 0.000 2.279 38.182 38.182 - LGA K 264 K 264 1.607 0 0.100 0.422 1.955 50.909 55.758 1.129 LGA R 265 R 265 1.362 0 0.067 0.958 4.419 65.455 53.554 4.419 LGA T 266 T 266 1.176 0 0.045 0.072 1.305 73.636 70.130 1.142 LGA I 267 I 267 0.753 0 0.032 0.071 1.026 81.818 79.773 1.026 LGA R 268 R 268 0.430 0 0.028 0.954 2.311 95.455 80.496 2.248 LGA P 269 P 269 0.132 0 0.000 0.023 0.381 100.000 100.000 0.381 LGA E 270 E 270 0.394 0 0.025 0.253 1.317 100.000 84.444 1.317 LGA K 271 K 271 0.807 0 0.083 0.719 4.315 81.818 53.333 4.256 LGA E 272 E 272 0.641 0 0.055 0.100 1.752 90.909 76.970 1.752 LGA Q 273 Q 273 0.251 0 0.047 0.109 0.339 100.000 100.000 0.300 LGA I 274 I 274 0.245 0 0.032 0.103 0.796 100.000 97.727 0.796 LGA V 275 V 275 0.292 0 0.000 0.027 0.565 95.455 97.403 0.440 LGA V 276 V 276 0.243 0 0.060 0.065 0.474 100.000 100.000 0.337 LGA Q 277 Q 277 0.171 0 0.042 0.574 2.578 100.000 79.596 2.578 LGA D 278 D 278 0.117 0 0.029 0.234 0.638 100.000 95.455 0.638 LGA A 279 A 279 0.155 0 0.016 0.025 0.189 100.000 100.000 - LGA H 280 H 280 0.141 0 0.033 0.211 0.509 100.000 98.182 0.457 LGA A 281 A 281 0.216 0 0.015 0.019 0.298 100.000 100.000 - LGA P 282 P 282 0.188 0 0.046 0.056 0.264 100.000 100.000 0.264 LGA I 283 I 283 0.324 0 0.045 0.061 0.550 95.455 97.727 0.419 LGA I 284 I 284 0.248 0 0.000 0.072 0.270 100.000 100.000 0.151 LGA D 285 D 285 0.404 0 0.020 0.246 1.067 100.000 91.136 1.067 LGA K 286 K 286 0.498 0 0.000 0.252 1.272 90.909 86.061 1.272 LGA E 287 E 287 0.686 0 0.007 0.293 2.303 86.364 72.121 1.799 LGA Q 288 Q 288 0.504 0 0.028 0.537 1.560 90.909 75.354 1.555 LGA F 289 F 289 0.217 0 0.028 0.123 0.484 100.000 100.000 0.409 LGA Q 290 Q 290 0.445 0 0.019 1.237 3.447 100.000 67.475 3.447 LGA Q 291 Q 291 0.324 0 0.038 0.109 0.789 100.000 91.919 0.615 LGA S 292 S 292 0.015 0 0.057 0.689 2.298 100.000 89.697 2.298 LGA Q 293 Q 293 0.378 0 0.000 0.242 0.785 95.455 91.919 0.785 LGA V 294 V 294 0.519 0 0.037 0.062 0.731 90.909 87.013 0.687 LGA K 295 K 295 0.268 0 0.048 0.167 0.803 90.909 91.919 0.713 LGA I 296 I 296 0.700 0 0.016 0.079 1.175 82.273 86.591 0.472 LGA A 297 A 297 1.182 0 0.111 0.127 1.882 65.909 65.818 - LGA N 298 N 298 0.807 0 0.000 0.280 2.059 63.182 68.409 1.359 LGA K 299 K 299 3.208 0 0.320 0.666 13.570 42.727 18.990 13.570 LGA V 300 V 300 1.569 0 0.146 0.148 4.008 54.545 36.104 4.008 # RMSD_GDC results: CA MC common percent ALL common percent GDC_mc GDC_all GDC_at NUMBER_OF_ATOMS_AA: 135 540 540 100.00 1090 1090 100.00 135 119 SUMMARY(RMSD_GDC): 0.922 0.879 1.784 86.946 81.296 67.670 #CA N1 N2 DIST N RMSD GDT_TS LGA_S3 LGA_Q SUMMARY(GDT) 136 135 4.0 135 0.92 95.370 97.882 13.214 LGA_LOCAL RMSD: 0.922 Number of atoms: 135 under DIST: 4.00 LGA_ASGN_ATOMS RMSD: 0.922 Number of assigned atoms: 135 Std_ASGN_ATOMS RMSD: 0.922 Standard rmsd on all 135 assigned CA atoms Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules (1=>2) X_new = 0.097351 * X + 0.955829 * Y + 0.277334 * Z + 154.203720 Y_new = 0.098191 * X + 0.268074 * Y + -0.958382 * Z + 149.341812 Z_new = -0.990395 * X + 0.120531 * Y + -0.067756 * Z + 140.671524 Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ: Phi Theta Psi [DEG: Phi Theta Psi ] XYZ: 0.789692 1.432082 2.082918 [DEG: 45.2460 82.0523 119.3424 ] ZXZ: 0.281683 1.638605 -1.449692 [DEG: 16.1392 93.8851 -83.0612 ] # END of job REMARK ---------------------------------------------------------- REMARK Citing LGA: REMARK Zemla A., LGA - a Method for Finding 3D Similarities in REMARK Protein Structures, Nucleic Acids Research, 2003, V. 31, REMARK No. 13, pp. 3370-3374. REMARK ---------------------------------------------------------- REMARK Superimposed MOLECULES (1=>2) Output: 1 molecule REMARK 1: T1228v2TS304_4-D2 REMARK 2: T1228v2-D2.pdb REMARK GDT and LCS analysis REMARK FIXED Atom-Atom correspondence REMARK LGA parameters: -3 -ie -o1 -sda -d:4 -gdc_sc -swap T1228v2TS304_4-D2.lga REMARK #CA N1 N2 DIST N RMSD LGA_S3 RMSD_global REMARK SUMMARY: 136 135 4.0 135 0.92 97.882 0.92 REMARK ---------------------------------------------------------- MOLECULE T1228v2TS304_4-D2 PFRMAT TS TARGET T1228v2 MODEL 4 PARENT None ATOM 1345 N GLY 165 153.922 185.130 153.533 1.00 85.73 N ATOM 1346 CA GLY 165 153.309 185.846 154.660 1.00 85.89 C ATOM 1347 C GLY 165 151.789 185.704 154.762 1.00 87.27 C ATOM 1348 O GLY 165 151.147 186.451 155.499 1.00 84.79 O ATOM 1349 N LYS 166 151.184 184.753 154.041 1.00 87.06 N ATOM 1350 CA LYS 166 149.748 184.477 154.112 1.00 86.91 C ATOM 1351 C LYS 166 149.430 183.658 155.369 1.00 87.67 C ATOM 1352 O LYS 166 150.157 182.731 155.728 1.00 85.71 O ATOM 1353 CB LYS 166 149.250 183.789 152.820 1.00 85.41 C ATOM 1354 CG LYS 166 149.417 184.672 151.559 1.00 82.21 C ATOM 1355 CD LYS 166 148.871 184.044 150.267 1.00 79.12 C ATOM 1356 CE LYS 166 149.074 185.009 149.084 1.00 73.90 C ATOM 1357 NZ LYS 166 148.541 184.544 147.770 1.00 67.15 N ATOM 1358 N TRP 167 148.320 183.980 156.026 1.00 87.70 N ATOM 1359 CA TRP 167 147.842 183.231 157.191 1.00 88.30 C ATOM 1360 C TRP 167 146.996 182.042 156.743 1.00 87.87 C ATOM 1361 O TRP 167 145.909 182.214 156.197 1.00 85.16 O ATOM 1362 CB TRP 167 147.070 184.153 158.128 1.00 87.68 C ATOM 1363 CG TRP 167 146.725 183.506 159.429 1.00 87.88 C ATOM 1364 CD1 TRP 167 145.596 182.817 159.700 1.00 84.99 C ATOM 1365 CD2 TRP 167 147.545 183.445 160.640 1.00 86.46 C ATOM 1366 NE1 TRP 167 145.652 182.342 161.008 1.00 84.69 N ATOM 1367 CE2 TRP 167 146.829 182.707 161.608 1.00 85.80 C ATOM 1368 CE3 TRP 167 148.813 183.953 160.984 1.00 85.65 C ATOM 1369 CZ2 TRP 167 147.358 182.466 162.897 1.00 85.23 C ATOM 1370 CZ3 TRP 167 149.336 183.717 162.264 1.00 83.84 C ATOM 1371 CH2 TRP 167 148.613 182.977 163.210 1.00 83.18 C ATOM 1372 N ILE 168 147.480 180.838 156.992 1.00 85.14 N ATOM 1373 CA ILE 168 146.875 179.586 156.529 1.00 83.27 C ATOM 1374 C ILE 168 146.513 178.622 157.667 1.00 82.02 C ATOM 1375 O ILE 168 146.182 177.458 157.434 1.00 76.08 O ATOM 1376 CB ILE 168 147.788 178.907 155.491 1.00 80.04 C ATOM 1377 CG1 ILE 168 149.192 178.639 156.075 1.00 75.93 C ATOM 1378 CG2 ILE 168 147.873 179.759 154.213 1.00 73.27 C ATOM 1379 CD1 ILE 168 149.994 177.656 155.232 1.00 69.51 C ATOM 1380 N SER 169 146.599 179.091 158.890 1.00 82.20 N ATOM 1381 CA SER 169 146.236 178.338 160.093 1.00 80.65 C ATOM 1382 C SER 169 144.765 178.569 160.473 1.00 79.77 C ATOM 1383 O SER 169 143.992 179.085 159.667 1.00 73.49 O ATOM 1384 CB SER 169 147.214 178.683 161.214 1.00 77.01 C ATOM 1385 OG SER 169 148.509 178.241 160.881 1.00 72.07 O ATOM 1386 N GLY 170 144.365 178.156 161.665 1.00 76.67 N ATOM 1387 CA GLY 170 142.981 178.269 162.130 1.00 76.10 C ATOM 1388 C GLY 170 142.523 179.707 162.398 1.00 79.18 C ATOM 1389 O GLY 170 142.626 180.578 161.539 1.00 75.75 O ATOM 1390 N LEU 171 142.017 179.950 163.611 1.00 80.59 N ATOM 1391 CA LEU 171 141.581 181.284 164.030 1.00 80.37 C ATOM 1392 C LEU 171 142.742 182.280 163.941 1.00 81.83 C ATOM 1393 O LEU 171 143.858 181.976 164.367 1.00 79.86 O ATOM 1394 CB LEU 171 141.027 181.217 165.464 1.00 77.07 C ATOM 1395 CG LEU 171 139.663 180.514 165.568 1.00 72.78 C ATOM 1396 CD1 LEU 171 139.390 180.085 167.003 1.00 67.13 C ATOM 1397 CD2 LEU 171 138.520 181.432 165.117 1.00 65.96 C ATOM 1398 N ALA 172 142.440 183.460 163.417 1.00 83.90 N ATOM 1399 CA ALA 172 143.371 184.579 163.454 1.00 84.54 C ATOM 1400 C ALA 172 143.720 184.932 164.917 1.00 85.69 C ATOM 1401 O ALA 172 142.871 184.760 165.802 1.00 84.04 O ATOM 1402 CB ALA 172 142.744 185.762 162.712 1.00 82.64 C ATOM 1403 N PRO 173 144.942 185.394 165.196 1.00 86.96 N ATOM 1404 CA PRO 173 145.306 185.847 166.531 1.00 87.31 C ATOM 1405 C PRO 173 144.467 187.069 166.932 1.00 87.90 C ATOM 1406 O PRO 173 144.023 187.840 166.080 1.00 86.50 O ATOM 1407 CB PRO 173 146.799 186.160 166.454 1.00 85.78 C ATOM 1408 CG PRO 173 147.015 186.520 164.985 1.00 82.56 C ATOM 1409 CD PRO 173 146.025 185.619 164.250 1.00 85.44 C ATOM 1410 N TYR 174 144.257 187.245 168.228 1.00 89.38 N ATOM 1411 CA TYR 174 143.531 188.395 168.756 1.00 89.60 C ATOM 1412 C TYR 174 144.195 189.705 168.321 1.00 89.61 C ATOM 1413 O TYR 174 145.414 189.792 168.314 1.00 87.67 O ATOM 1414 CB TYR 174 143.464 188.279 170.278 1.00 89.38 C ATOM 1415 CG TYR 174 142.623 189.349 170.933 1.00 90.18 C ATOM 1416 CD1 TYR 174 143.229 190.381 171.673 1.00 83.78 C ATOM 1417 CD2 TYR 174 141.220 189.327 170.790 1.00 84.25 C ATOM 1418 CE1 TYR 174 142.441 191.374 172.274 1.00 83.21 C ATOM 1419 CE2 TYR 174 140.428 190.321 171.384 1.00 83.42 C ATOM 1420 CZ TYR 174 141.042 191.341 172.127 1.00 87.85 C ATOM 1421 OH TYR 174 140.269 192.315 172.703 1.00 86.99 O ATOM 1422 N GLY 175 143.405 190.676 167.928 1.00 88.68 N ATOM 1423 CA GLY 175 143.882 191.923 167.326 1.00 88.72 C ATOM 1424 C GLY 175 143.944 191.907 165.801 1.00 90.15 C ATOM 1425 O GLY 175 144.087 192.960 165.186 1.00 87.55 O ATOM 1426 N TYR 176 143.815 190.735 165.181 1.00 90.66 N ATOM 1427 CA TYR 176 143.811 190.577 163.732 1.00 91.10 C ATOM 1428 C TYR 176 142.579 189.816 163.238 1.00 90.93 C ATOM 1429 O TYR 176 142.037 188.940 163.909 1.00 89.18 O ATOM 1430 CB TYR 176 145.082 189.863 163.275 1.00 91.13 C ATOM 1431 CG TYR 176 146.356 190.658 163.441 1.00 91.84 C ATOM 1432 CD1 TYR 176 146.706 191.639 162.497 1.00 86.44 C ATOM 1433 CD2 TYR 176 147.220 190.412 164.526 1.00 86.71 C ATOM 1434 CE1 TYR 176 147.901 192.358 162.617 1.00 85.48 C ATOM 1435 CE2 TYR 176 148.418 191.124 164.658 1.00 85.80 C ATOM 1436 CZ TYR 176 148.760 192.095 163.697 1.00 90.18 C ATOM 1437 OH TYR 176 149.938 192.787 163.810 1.00 89.25 O ATOM 1438 N GLN 177 142.179 190.108 162.002 1.00 90.12 N ATOM 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