####################################################### # # # LGA # # --------------- # # # # Local-Global Alignment # # A Method for Finding 3-D Similarities # # in Protein Structures # # # # ------------ 09/2019 # # # # Adam Zemla (zemla1@llnl.gov) # # Lawrence Livermore National Laboratory, CA # # # ####################################################### # Molecule1: number of CA atoms 136 ( 1097), selected 135 , name T1228v2TS231_5-D2 # Molecule2: number of CA atoms 135 ( 2219), selected 135 , name T1228v2-D2.pdb # PARAMETERS: -3 -ie -o1 -sda -d:4 -gdc_sc -swap T1228v2TS231_5-D2.lga # FIXED Atom-Atom correspondence # GDT and LCS analysis LCS - RMSD CUTOFF 5.00 length segment l_RMS g_RMS LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT: 135 165 - 300 0.82 0.82 LCS_AVERAGE: 100.00 LCS - RMSD CUTOFF 2.00 length segment l_RMS g_RMS LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT: 135 165 - 300 0.82 0.82 LCS_AVERAGE: 100.00 LCS - RMSD CUTOFF 1.00 length segment l_RMS g_RMS LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT: 135 165 - 300 0.82 0.82 LCS_AVERAGE: 100.00 LCS_GDT MOLECULE-1 MOLECULE-2 LCS_DETAILS GDT_DETAILS TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS: 135 LCS_GDT RESIDUE RESIDUE SEGMENT_SIZE GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair LCS_GDT NAME NUMBER NAME NUMBER 1.0 2.0 5.0 0.5 1.0 1.5 2.0 2.5 3.0 3.5 4.0 4.5 5.0 5.5 6.0 6.5 7.0 7.5 8.0 8.5 9.0 9.5 10.0 LCS_GDT G 165 G 165 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 166 K 166 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT W 167 W 167 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT I 168 I 168 135 135 135 84 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT S 169 S 169 135 135 135 11 68 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT G 170 G 170 135 135 135 13 108 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT L 171 L 171 135 135 135 56 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT A 172 A 172 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT P 173 P 173 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Y 174 Y 174 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT G 175 G 175 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Y 176 Y 176 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Q 177 Q 177 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT L 178 L 178 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT N 179 N 179 135 135 135 4 105 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 180 K 180 135 135 135 3 3 4 36 67 132 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 181 K 181 135 135 135 5 109 126 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT T 182 T 182 135 135 135 20 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT S 183 S 183 135 135 135 82 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 184 K 184 135 135 135 74 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT L 185 L 185 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT D 186 D 186 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT P 187 P 187 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT V 188 V 188 135 135 135 76 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT E 189 E 189 135 135 135 76 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT D 190 D 190 135 135 135 84 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT E 191 E 191 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT A 192 A 192 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 193 K 193 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT V 194 V 194 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT V 195 V 195 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Q 196 Q 196 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT L 197 L 197 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 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135 135 LCS_GDT F 289 F 289 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Q 290 Q 290 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Q 291 Q 291 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT S 292 S 292 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT Q 293 Q 293 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT V 294 V 294 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 295 K 295 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT I 296 I 296 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT A 297 A 297 135 135 135 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT N 298 N 298 135 135 135 45 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT K 299 K 299 135 135 135 7 114 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_GDT V 300 V 300 135 135 135 7 76 126 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 LCS_AVERAGE LCS_A: 100.00 ( 100.00 100.00 100.00 ) GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds) GDT DIST_CUTOFF 0.50 1.00 1.50 2.00 2.50 3.00 3.50 4.00 4.50 5.00 5.50 6.00 6.50 7.00 7.50 8.00 8.50 9.00 9.50 10.00 GDT NUMBER_AT 86 116 127 133 133 134 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 135 GDT PERCENT_AT 63.70 85.93 94.07 98.52 98.52 99.26 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 GDT RMS_LOCAL 0.28 0.44 0.58 0.70 0.70 0.74 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 GDT RMS_ALL_AT 0.84 0.84 0.83 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 # Checking swapping # possible swapping detected: Y 174 Y 174 # possible swapping detected: E 189 E 189 # possible swapping detected: E 191 E 191 # possible swapping detected: F 199 F 199 # possible swapping detected: F 202 F 202 # possible swapping detected: Y 211 Y 211 # possible swapping detected: E 258 E 258 # possible swapping detected: E 270 E 270 # possible swapping detected: E 272 E 272 # possible swapping detected: D 285 D 285 # possible swapping detected: E 287 E 287 # possible swapping detected: F 289 F 289 # Molecule1 Molecule2 DISTANCE Mis MC All Dist_max GDC_mc GDC_all Dist_at LGA G 165 G 165 0.419 0 0.031 0.031 0.419 100.000 100.000 - LGA K 166 K 166 0.228 0 0.034 0.140 0.960 100.000 97.980 0.960 LGA W 167 W 167 0.207 0 0.218 0.229 0.704 95.455 96.104 0.521 LGA I 168 I 168 0.759 0 0.065 0.871 2.381 81.818 70.227 1.371 LGA S 169 S 169 1.328 0 0.557 0.584 2.504 60.000 54.848 2.347 LGA G 170 G 170 1.540 0 0.085 0.085 1.746 58.182 58.182 - LGA L 171 L 171 0.880 0 0.051 1.395 5.638 77.727 52.727 2.922 LGA A 172 A 172 0.481 0 0.016 0.022 0.650 95.455 96.364 - LGA P 173 P 173 0.132 0 0.000 0.213 0.528 100.000 97.403 0.528 LGA Y 174 Y 174 0.381 0 0.000 0.224 1.405 100.000 86.667 1.405 LGA G 175 G 175 0.288 0 0.060 0.060 0.327 100.000 100.000 - LGA Y 176 Y 176 0.336 0 0.000 0.171 0.542 100.000 96.970 0.265 LGA Q 177 Q 177 0.554 0 0.059 0.258 1.023 90.909 84.040 0.671 LGA L 178 L 178 0.343 0 0.130 0.203 1.687 90.909 82.500 1.687 LGA N 179 N 179 1.350 0 0.172 0.653 4.918 62.273 37.500 4.918 LGA K 180 K 180 4.032 0 0.280 0.970 13.514 19.091 8.485 13.514 LGA K 181 K 181 1.712 0 0.455 1.170 11.975 65.909 30.505 11.975 LGA T 182 T 182 0.937 0 0.029 1.113 3.495 77.727 65.974 3.495 LGA S 183 S 183 0.651 0 0.111 0.099 1.029 86.364 82.121 0.936 LGA K 184 K 184 0.736 0 0.070 0.866 2.898 81.818 72.121 2.898 LGA L 185 L 185 0.369 0 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0.245 0 0.006 0.039 0.298 100.000 100.000 0.203 LGA F 202 F 202 0.211 0 0.020 0.037 0.375 100.000 100.000 0.375 LGA L 203 L 203 0.288 0 0.016 0.054 0.545 100.000 97.727 0.437 LGA N 204 N 204 0.297 0 0.000 0.102 1.079 100.000 91.136 0.877 LGA G 205 G 205 0.182 0 0.045 0.045 0.223 100.000 100.000 - LGA L 206 L 206 0.195 0 0.031 0.177 0.954 95.455 93.182 0.775 LGA N 207 N 207 0.682 0 0.000 0.183 1.333 86.364 82.045 0.805 LGA G 208 G 208 0.862 0 0.091 0.091 1.377 73.636 73.636 - LGA K 209 K 209 1.127 0 0.054 0.635 1.561 69.545 71.313 1.098 LGA D 210 D 210 1.085 0 0.060 0.741 1.920 69.545 63.864 1.824 LGA Y 211 Y 211 1.556 0 0.112 0.603 2.102 58.182 55.909 1.769 LGA S 212 S 212 2.110 0 0.638 0.777 5.750 41.818 29.697 5.750 LGA Y 213 Y 213 3.077 0 0.168 1.103 14.552 36.364 12.273 14.552 LGA A 215 A 215 0.786 0 0.197 0.215 1.848 95.455 86.545 - LGA I 216 I 216 0.273 0 0.000 0.138 0.500 100.000 100.000 0.500 LGA A 217 A 217 0.161 0 0.050 0.063 0.247 100.000 100.000 - LGA S 218 S 218 0.373 0 0.027 0.110 1.075 100.000 91.212 1.075 LGA H 219 H 219 0.292 0 0.000 0.092 0.767 100.000 92.727 0.767 LGA L 220 L 220 0.298 0 0.000 0.077 0.400 100.000 100.000 0.400 LGA T 221 T 221 0.248 0 0.000 0.035 0.385 100.000 100.000 0.151 LGA N 222 N 222 0.484 0 0.040 0.065 0.686 90.909 95.455 0.492 LGA L 223 L 223 0.661 0 0.043 0.070 0.988 81.818 81.818 0.777 LGA Q 224 Q 224 0.619 0 0.038 0.161 0.999 81.818 81.818 0.715 LGA I 225 I 225 0.564 0 0.041 0.106 0.598 81.818 86.364 0.231 LGA P 226 P 226 0.591 0 0.040 0.063 0.859 81.818 81.818 0.859 LGA T 227 T 227 0.566 0 0.033 0.076 0.732 81.818 84.416 0.732 LGA P 228 P 228 0.735 0 0.090 0.093 0.785 81.818 81.818 0.595 LGA S 229 S 229 0.965 0 0.143 0.157 1.032 77.727 79.091 0.695 LGA G 230 G 230 0.986 0 0.067 0.067 1.070 73.636 73.636 - LGA K 231 K 231 0.470 0 0.035 0.485 1.087 95.455 86.061 0.741 LGA K 232 K 232 0.396 0 0.077 0.241 1.034 95.455 92.121 1.034 LGA R 233 R 233 0.372 0 0.024 1.211 5.449 100.000 63.967 4.138 LGA W 234 W 234 0.312 0 0.035 0.131 0.670 100.000 92.208 0.649 LGA N 235 N 235 0.534 0 0.022 0.554 2.157 86.364 76.591 2.157 LGA Q 236 Q 236 0.682 0 0.000 0.793 2.985 81.818 61.212 2.985 LGA Y 237 Y 237 0.756 0 0.059 0.124 1.321 81.818 73.636 1.321 LGA T 238 T 238 0.380 0 0.000 0.039 0.414 100.000 100.000 0.376 LGA I 239 I 239 0.348 0 0.010 0.102 0.388 100.000 100.000 0.351 LGA K 240 K 240 0.640 0 0.023 0.186 2.829 86.364 66.465 2.829 LGA A 241 A 241 0.483 0 0.085 0.090 0.581 90.909 89.091 - LGA I 242 I 242 0.081 0 0.039 0.067 0.159 100.000 100.000 0.158 LGA L 243 L 243 0.187 0 0.041 0.061 0.526 95.455 97.727 0.312 LGA Q 244 Q 244 0.133 0 0.040 0.202 0.616 100.000 95.960 0.598 LGA N 245 N 245 0.113 0 0.020 0.098 0.497 100.000 100.000 0.497 LGA E 246 E 246 0.158 0 0.028 0.475 1.449 100.000 94.141 0.952 LGA V 247 V 247 0.203 0 0.015 0.043 0.386 100.000 100.000 0.324 LGA Y 248 Y 248 0.286 0 0.034 0.120 1.137 100.000 91.061 1.137 LGA I 249 I 249 0.182 0 0.011 0.031 0.238 100.000 100.000 0.183 LGA G 250 G 250 0.199 0 0.055 0.055 0.259 100.000 100.000 - LGA T 251 T 251 0.184 0 0.036 0.044 0.336 100.000 100.000 0.238 LGA V 252 V 252 0.333 0 0.052 0.108 0.639 100.000 97.403 0.639 LGA K 253 K 253 0.541 0 0.060 0.145 0.893 95.455 87.879 0.772 LGA Y 254 Y 254 0.571 0 0.031 0.222 2.324 95.455 70.909 2.324 LGA K 255 K 255 0.612 0 0.000 0.152 1.201 81.818 80.000 1.201 LGA V 256 V 256 0.796 0 0.066 0.068 0.829 81.818 81.818 0.753 LGA R 257 R 257 0.910 0 0.104 1.080 5.384 77.727 55.868 3.131 LGA E 258 E 258 0.959 0 0.058 0.324 1.845 73.636 69.293 1.845 LGA K 259 K 259 1.393 0 0.044 0.226 1.747 65.455 60.606 1.455 LGA T 260 T 260 1.282 0 0.016 0.083 1.742 58.182 61.299 1.105 LGA K 261 K 261 2.087 0 0.022 0.263 3.669 41.364 35.354 3.669 LGA D 262 D 262 1.697 0 0.027 0.904 3.185 50.909 44.091 2.790 LGA G 263 G 263 1.827 0 0.000 0.000 1.827 50.909 50.909 - LGA K 264 K 264 1.246 0 0.083 0.428 1.938 65.455 62.222 1.846 LGA R 265 R 265 1.162 0 0.069 0.808 2.764 69.545 65.124 2.764 LGA T 266 T 266 0.963 0 0.036 0.071 1.087 77.727 79.481 0.881 LGA I 267 I 267 0.675 0 0.028 0.066 0.911 81.818 81.818 0.901 LGA R 268 R 268 0.380 0 0.029 0.971 2.918 100.000 85.620 2.918 LGA P 269 P 269 0.242 0 0.000 0.024 0.283 100.000 100.000 0.283 LGA E 270 E 270 0.475 0 0.038 0.646 1.453 95.455 82.424 1.453 LGA K 271 K 271 0.517 0 0.081 0.729 4.615 95.455 60.808 4.451 LGA E 272 E 272 0.315 0 0.056 0.098 1.208 100.000 88.283 1.208 LGA Q 273 Q 273 0.068 0 0.044 0.094 0.277 100.000 100.000 0.277 LGA I 274 I 274 0.136 0 0.029 0.103 0.724 100.000 97.727 0.724 LGA V 275 V 275 0.340 0 0.000 0.017 0.560 95.455 92.208 0.555 LGA V 276 V 276 0.273 0 0.072 0.077 0.537 95.455 97.403 0.315 LGA Q 277 Q 277 0.123 0 0.051 0.561 2.367 100.000 80.808 2.367 LGA D 278 D 278 0.033 0 0.033 0.231 0.667 100.000 95.455 0.667 LGA A 279 A 279 0.158 0 0.000 0.018 0.218 100.000 100.000 - LGA H 280 H 280 0.210 0 0.027 0.214 0.555 100.000 98.182 0.431 LGA A 281 A 281 0.321 0 0.025 0.027 0.422 100.000 100.000 - LGA P 282 P 282 0.170 0 0.045 0.057 0.274 100.000 100.000 0.274 LGA I 283 I 283 0.353 0 0.053 0.064 0.607 95.455 95.455 0.460 LGA I 284 I 284 0.221 0 0.000 0.075 0.270 100.000 100.000 0.136 LGA D 285 D 285 0.244 0 0.008 0.670 1.700 100.000 89.545 1.700 LGA K 286 K 286 0.258 0 0.000 0.239 1.412 100.000 92.121 1.412 LGA E 287 E 287 0.309 0 0.025 0.302 2.032 100.000 80.202 1.828 LGA Q 288 Q 288 0.265 0 0.023 0.326 2.224 100.000 80.202 1.684 LGA F 289 F 289 0.107 0 0.017 0.101 0.377 100.000 100.000 0.290 LGA Q 290 Q 290 0.179 0 0.022 1.190 3.817 100.000 70.303 3.817 LGA Q 291 Q 291 0.071 0 0.032 0.083 0.374 100.000 100.000 0.374 LGA S 292 S 292 0.125 0 0.035 0.736 2.187 100.000 89.697 2.187 LGA Q 293 Q 293 0.251 0 0.000 0.251 0.754 100.000 93.939 0.754 LGA V 294 V 294 0.271 0 0.040 0.051 0.511 100.000 97.403 0.493 LGA K 295 K 295 0.192 0 0.052 0.196 0.490 100.000 100.000 0.361 LGA I 296 I 296 0.359 0 0.027 0.063 0.648 100.000 97.727 0.404 LGA A 297 A 297 0.450 0 0.076 0.087 0.631 95.455 92.727 - LGA N 298 N 298 0.825 0 0.000 0.229 1.338 82.273 73.864 1.088 LGA K 299 K 299 1.222 0 0.041 0.176 2.476 62.273 57.778 2.476 LGA V 300 V 300 1.734 0 0.124 0.131 2.805 45.000 40.519 2.221 # RMSD_GDC results: CA MC common percent ALL common percent GDC_mc GDC_all GDC_at NUMBER_OF_ATOMS_AA: 135 540 540 100.00 1090 1090 100.00 135 119 SUMMARY(RMSD_GDC): 0.821 0.798 1.639 88.663 83.219 70.191 #CA N1 N2 DIST N RMSD GDT_TS LGA_S3 LGA_Q SUMMARY(GDT) 136 135 4.0 135 0.82 96.111 98.200 14.657 LGA_LOCAL RMSD: 0.821 Number of atoms: 135 under DIST: 4.00 LGA_ASGN_ATOMS RMSD: 0.821 Number of assigned atoms: 135 Std_ASGN_ATOMS RMSD: 0.821 Standard rmsd on all 135 assigned CA atoms Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules (1=>2) X_new = -0.494582 * X + -0.764917 * Y + 0.412663 * Z + 153.918472 Y_new = 0.584648 * X + 0.058515 * Y + 0.809174 * Z + 148.972595 Z_new = -0.643098 * X + 0.641466 * Y + 0.418267 * Z + 141.829529 Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ: Phi Theta Psi [DEG: Phi Theta Psi ] XYZ: 2.272933 0.698536 0.992982 [DEG: 130.2295 40.0232 56.8937 ] ZXZ: 2.669993 1.139260 -0.786669 [DEG: 152.9793 65.2748 -45.0728 ] # END of job REMARK ---------------------------------------------------------- REMARK Citing LGA: REMARK Zemla A., LGA - a Method for Finding 3D Similarities in REMARK Protein Structures, Nucleic Acids Research, 2003, V. 31, REMARK No. 13, pp. 3370-3374. REMARK ---------------------------------------------------------- REMARK Superimposed MOLECULES (1=>2) Output: 1 molecule REMARK 1: T1228v2TS231_5-D2 REMARK 2: T1228v2-D2.pdb REMARK GDT and LCS analysis REMARK FIXED Atom-Atom correspondence REMARK LGA parameters: -3 -ie -o1 -sda -d:4 -gdc_sc -swap T1228v2TS231_5-D2.lga REMARK #CA N1 N2 DIST N RMSD LGA_S3 RMSD_global REMARK SUMMARY: 136 135 4.0 135 0.82 98.200 0.82 REMARK ---------------------------------------------------------- MOLECULE T1228v2TS231_5-D2 PFRMAT TS TARGET T1228v2 MODEL 5 PARENT N/A ATOM 1345 N GLY 165 154.086 185.132 153.430 0.00 0.00 ATOM 1346 CA GLY 165 153.480 185.864 154.549 0.00 0.00 ATOM 1347 C GLY 165 151.955 185.743 154.643 0.00 0.00 ATOM 1348 O GLY 165 151.320 186.514 155.362 0.00 0.00 ATOM 1349 N LYS 166 151.340 184.797 153.927 0.00 0.00 ATOM 1350 CA LYS 166 149.897 184.541 153.995 0.00 0.00 ATOM 1351 C LYS 166 149.564 183.715 155.245 0.00 0.00 ATOM 1352 O LYS 166 150.289 182.789 155.604 0.00 0.00 ATOM 1353 CB LYS 166 149.390 183.875 152.699 0.00 0.00 ATOM 1354 CG LYS 166 149.575 184.764 151.447 0.00 0.00 ATOM 1355 CD LYS 166 149.038 184.138 150.149 0.00 0.00 ATOM 1356 CE LYS 166 149.256 185.102 148.972 0.00 0.00 ATOM 1357 NZ LYS 166 148.767 184.610 147.654 0.00 0.00 ATOM 1358 N TRP 167 148.441 184.022 155.889 0.00 0.00 ATOM 1359 CA TRP 167 147.941 183.261 157.037 0.00 0.00 ATOM 1360 C TRP 167 147.101 182.075 156.568 0.00 0.00 ATOM 1361 O TRP 167 146.069 182.255 155.921 0.00 0.00 ATOM 1362 CB TRP 167 147.148 184.179 157.957 0.00 0.00 ATOM 1363 CG TRP 167 146.747 183.520 159.238 0.00 0.00 ATOM 1364 CD1 TRP 167 145.586 182.867 159.465 0.00 0.00 ATOM 1365 CD2 TRP 167 147.528 183.413 160.471 0.00 0.00 ATOM 1366 NE1 TRP 167 145.585 182.370 160.765 0.00 0.00 ATOM 1367 CE2 TRP 167 146.753 182.682 161.408 0.00 0.00 ATOM 1368 CE3 TRP 167 148.800 183.872 160.868 0.00 0.00 ATOM 1369 CZ2 TRP 167 147.234 182.407 162.707 0.00 0.00 ATOM 1370 CZ3 TRP 167 149.272 183.599 162.160 0.00 0.00 ATOM 1371 CH2 TRP 167 148.496 182.871 163.068 0.00 0.00 ATOM 1372 N ILE 168 147.527 180.867 156.899 0.00 0.00 ATOM 1373 CA ILE 168 146.949 179.610 156.394 0.00 0.00 ATOM 1374 C ILE 168 146.424 178.710 157.521 0.00 0.00 ATOM 1375 O ILE 168 145.734 177.720 157.275 0.00 0.00 ATOM 1376 CB ILE 168 147.990 178.846 155.547 0.00 0.00 ATOM 1377 CG1 ILE 168 148.868 179.778 154.685 0.00 0.00 ATOM 1378 CG2 ILE 168 147.279 177.851 154.609 0.00 0.00 ATOM 1379 CD1 ILE 168 150.087 179.052 154.129 0.00 0.00 ATOM 1380 N SER 169 146.755 179.032 158.756 0.00 0.00 ATOM 1381 CA SER 169 146.297 178.302 159.938 0.00 0.00 ATOM 1382 C SER 169 144.909 178.771 160.390 0.00 0.00 ATOM 1383 O SER 169 144.334 179.664 159.786 0.00 0.00 ATOM 1384 CB SER 169 147.346 178.409 161.036 0.00 0.00 ATOM 1385 OG SER 169 148.513 177.728 160.642 0.00 0.00 ATOM 1386 N GLY 170 144.366 178.146 161.442 0.00 0.00 ATOM 1387 CA GLY 170 142.981 178.322 161.891 0.00 0.00 ATOM 1388 C GLY 170 142.521 179.755 162.185 0.00 0.00 ATOM 1389 O GLY 170 142.508 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