Viewer - CASP13

PFRMAT QA
TARGET T1023s3
AUTHOR 8033-6121-0710
REMARK Sscore was used for superposition
REMARK Error estimate is CA-CA rms distance in Angstroms
REMARK Global quality estimate is average S-score normalised by len=472
REMARK Input directory: T1023s3/qa/stage2/
REMARK Total number of pdbs: 150
REMARK Total number of comparisons: 10716
REMARK Total CPU time used:    88.74 seconds
REMARK Total time used: 43.855848 seconds
REMARK LGscore parameters superimpose_all=0 L=4 minsim=121.000000 factor=0.500000 step=2 d0=2.236068
REMARK Target sequence length (user defined): 472
REMARK Error estimate is CA-CA distance in Angstroms
METHOD ********************************************************************************
METHOD *                               PCONS                                          *
METHOD * Calculates the model quality based on structural consensus                   *
METHOD *                                                                              *
METHOD * Reference: Bjorn Wallner and Arne Elofsson, Protein Sci., 2006 15(4):900-913 *
METHOD * For comments, please email to: bjorn@sbc.su.se                               *
METHOD *                                                                              *
METHOD *                                                                              *
METHOD * Global: Average pairwise S-score divided by target length                    *
METHOD ********************************************************************************
METHOD -------------
MODEL 2
QMODE 2
3D-JIGSAW_SL1_TS1 0.115  15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
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7.838 7.416 7.325 3.579 3.922 5.095 4.799 5.373 4.129 2.609 3.120 3.544 4.259 3.784 3.072 4.075 
4.272 3.681 2.935 2.673 3.407 3.603 3.302 3.698 3.949 3.724 3.863 2.763 2.306 2.680 2.296 2.641 
3.004 2.008 2.325 1.944 2.352 3.075 2.834 3.937 2.647 2.867 2.553 2.280 2.372 2.479 2.217 2.120 
2.262 2.221 2.060 2.307 2.409 2.381 2.446 2.597 2.319 2.595 2.278 2.115 2.061 2.523 2.935 2.278 
2.160 1.863 2.060 2.384 2.302 2.849 3.426 3.037 2.595 2.775 3.062 3.325 2.801 2.399 2.523 2.399 
2.067 2.612 2.465 1.882 2.288 2.663 2.208 2.414 2.948 4.405 3.335 4.314 3.556 3.717 4.363 2.930 
1.943 1.870 1.911 1.864 2.008 2.679 4.008 4.272 4.435 3.847 3.294 2.113 2.827 2.997 3.282 3.850 
3.152 2.537 3.117 3.252 3.033 2.972 2.786 2.646 2.604 2.991 3.909 4.516 4.310 3.812 4.052 3.835 
3.916 4.809 3.959 4.261 3.153 3.181 2.792 2.919 3.997 6.681 5.442 5.776 5.743 5.030 6.543 6.926 
5.366 6.196 10.117 8.931 12.435 13.165 12.117 13.350 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
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15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
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15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
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Seok-assembly_TS1 0.384  15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
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2.784 2.941 2.680 2.471 2.746 2.553 2.324 2.191 2.333 2.343 2.179 2.157 2.470 2.372 2.165 2.162 
2.132 1.997 1.944 1.857 1.958 2.031 2.239 2.375 2.577 2.964 3.738 3.561 3.146 2.898 3.084 2.507 
2.566 2.581 2.424 2.228 2.106 2.119 2.374 2.284 2.173 2.259 2.686 2.950 2.696 2.809 2.438 1.956 
1.897 1.929 1.988 2.065 2.061 2.285 2.643 2.966 2.721 2.868 2.517 3.312 3.587 3.803 3.774 3.586 
3.723 3.907 3.965 3.946 4.458 4.147 3.859 4.347 4.587 4.244 4.454 4.744 4.562 4.897 3.869 2.437 
2.206 2.014 2.813 2.339 2.051 2.087 2.018 2.027 2.060 2.111 2.142 2.461 2.521 2.364 2.593 2.324 
2.388 2.460 2.300 2.111 2.148 2.237 2.303 2.043 2.126 2.170 1.818 1.761 2.047 2.021 2.009 2.353 
1.959 2.192 1.866 1.925 1.970 1.820 1.611 1.599 1.603 1.596 1.736 1.911 2.420 2.523 3.165 3.040 
2.223 2.707 3.600 3.311 3.512 3.274 3.231 3.309 3.318 3.094 2.912 2.211 2.380 2.590 2.433 1.936 
1.989 1.811 1.854 1.721 1.808 1.802 1.797 1.963 1.741 1.839 1.728 2.003 1.833 1.950 1.874 1.764 
1.699 1.947 2.226 2.133 2.678 2.962 3.052 2.737 3.490 4.463 4.525 4.736 4.910 5.576 2.846 2.171 
1.725 1.751 1.910 1.660 2.110 1.719 1.706 1.932 1.873 2.059 2.187 3.050 2.849 3.293 2.740 2.303 
2.265 2.100 2.055 1.924 2.373 2.705 3.508 3.447 2.765 2.315 2.327 2.346 2.480 2.910 3.115 3.444 
3.345 2.259 2.813 3.202 3.061 2.851 2.331 2.788 2.876 2.892 2.934 2.411 2.040 1.755 1.649 1.923 
1.934 1.820 2.283 2.565 3.133 2.186 1.787 1.616 1.811 1.991 1.796 1.867 1.937 1.905 2.044 2.043 
2.098 2.025 2.071 2.286 2.789 2.573 3.192 3.189 3.407 4.079 4.256 4.978 5.246 4.896 3.992 3.985 
3.277 3.107 2.465 2.452 2.458 2.317 2.204 2.243 2.322 2.522 2.283 2.337 2.119 2.120 1.777 1.808 
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2.504 2.359 2.004 1.999 1.863 1.826 1.891 1.744 1.618 1.787 1.502 1.824 3.652 4.711 2.951 3.158 
1.890 1.831 1.792 1.834 1.945 1.957 1.973 2.171 3.589 3.054 2.810 2.021 2.053 2.052 1.940 2.109 
1.998 2.099 2.050 1.905 2.098 3.513 4.205 6.319 6.181 9.005 9.619 13.182 13.806 13.192 13.727 
13.006 15.000
CMA-align_TS2 0.346  15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 13.480 11.673 10.480 9.944 8.271 6.866 7.116 6.375 4.365 3.501 2.824 2.487 
2.359 1.989 1.780 1.743 1.834 1.950 2.622 3.284 3.478 3.342 5.045 3.752 2.853 2.988 2.973 2.599 
1.962 1.999 2.686 2.718 2.793 3.016 3.359 4.224 5.135 5.395 6.148 6.500 6.273 5.786 6.353 6.436 
5.852 5.703 6.418 6.795 6.516 6.488 5.234 3.056 2.372 2.107 1.977 2.274 2.259 2.606 2.660 2.560 
3.105 3.156 3.443 6.435 6.351 5.536 6.780 6.732 7.598 8.857 6.265 7.365 4.533 4.664 4.463 5.761 
8.396 6.944 7.114 10.054 10.937 12.092 13.106 11.110 9.843 7.497 6.968 6.178 4.888 6.118 5.768 
5.648 5.941 5.344 4.868 4.260 4.232 3.702 3.275 2.824 2.585 2.227 2.058 1.988 2.014 2.087 2.379 
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