Viewer - CASP13

PFRMAT QA
TARGET T1023s1
AUTHOR 8033-6121-0710
REMARK Sscore was used for superposition
REMARK Error estimate is CA-CA rms distance in Angstroms
REMARK Global quality estimate is average S-score normalised by len=315
REMARK Input directory: T1023s1/qa/stage2/
REMARK Total number of pdbs: 150
REMARK Total number of comparisons: 10754
REMARK Total CPU time used:    39.89 seconds
REMARK Total time used: 27.358692 seconds
REMARK LGscore parameters superimpose_all=0 L=4 minsim=121.000000 factor=0.500000 step=2 d0=2.236068
REMARK Target sequence length (user defined): 315
REMARK Error estimate is CA-CA distance in Angstroms
METHOD ********************************************************************************
METHOD *                               PCONS                                          *
METHOD * Calculates the model quality based on structural consensus                   *
METHOD *                                                                              *
METHOD * Reference: Bjorn Wallner and Arne Elofsson, Protein Sci., 2006 15(4):900-913 *
METHOD * For comments, please email to: bjorn@sbc.su.se                               *
METHOD *                                                                              *
METHOD *                                                                              *
METHOD * Global: Average pairwise S-score divided by target length                    *
METHOD ********************************************************************************
METHOD -------------
MODEL 2
QMODE 2
3D-JIGSAW_SL1_TS1 0.218  15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 14.789 14.196 7.869 6.209 3.138 
2.876 3.499 2.793 2.526 1.891 2.015 1.765 1.665 1.924 1.921 1.953 2.132 1.815 2.179 2.121 1.894 
2.238 3.133 2.097 2.405 1.792 1.866 1.831 2.305 2.569 3.038 3.822 3.184 4.719 4.299 3.090 2.342 
1.617 1.555 1.634 2.136 2.782 2.064 2.231 2.580 3.549 4.630 4.711 5.564 4.102 3.803 2.998 2.172 
2.156 2.419 2.477 2.134 2.274 1.982 2.086 2.092 2.294 1.715 1.582 1.465 1.516 1.461 1.963 2.418 
2.801 5.121 5.676 6.980 6.838 4.587 3.060 2.605 2.338 1.702 1.726 1.719 2.358 2.570 2.185 2.899 
3.177 3.209 2.611 2.727 3.658 3.130 2.395 1.997 2.016 2.343 1.737 1.848 2.626 1.876 1.913 1.706 
2.247 1.944 2.557 3.296 2.878 3.909 4.972 3.926 4.403 6.111 5.817 5.040 6.456 5.756 6.720 6.420 
6.724 8.694 9.273 8.068 4.711 2.833 4.013 4.473 4.797 4.290 3.286 4.136 4.419 2.970 2.418 2.495 
2.715 2.756 2.376 2.525 2.891 3.558 3.456 5.854 7.318 3.736 3.082 3.604 3.805 2.391 2.084 2.801 
3.577 3.900 3.556 3.142 3.931 3.980 3.373 3.346 3.664 4.338 3.192 4.866 4.276 3.340 3.189 2.650 
2.624 1.995 2.010 2.227 2.503 2.737 3.847 4.511 3.571 3.850 3.989 3.715 3.003 3.909 6.571 8.254 
10.833 13.813 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 12.838 10.252 7.783 6.977 
9.347 10.621 10.112 11.748 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000
Seok-assembly_TS1 0.127  7.976 7.465 6.905 6.941 4.667 4.209 3.994 4.359 3.608 4.712 4.702 3.944 
3.749 4.003 4.335 4.373 4.282 4.015 3.891 3.384 3.395 3.028 3.826 3.853 4.446 4.671 4.761 4.831 
5.107 4.832 4.571 4.081 3.582 3.117 3.216 3.132 3.328 4.068 4.253 3.690 3.499 3.404 3.353 3.178 
3.508 3.663 5.332 5.062 5.425 4.677 5.174 5.491 6.511 7.394 7.942 7.768 8.447 8.339 8.420 8.329 
8.021 11.870 11.148 8.441 5.837 5.035 4.439 4.130 3.922 3.951 3.699 3.963 3.684 4.023 4.041 3.963 
4.260 4.360 4.757 5.103 4.618 4.419 3.880 3.923 3.817 4.143 4.618 4.528 5.344 5.045 5.850 7.264 
6.326 6.164 5.149 5.673 5.322 4.400 4.238 4.741 4.084 3.512 4.059 3.977 2.897 3.534 4.154 3.272 
3.741 4.767 4.596 4.689 5.909 7.972 7.403 6.358 8.725 5.252 5.729 6.310 5.532 6.344 5.210 7.408 
5.635 6.808 7.458 7.068 5.960 5.475 4.713 4.503 3.595 3.060 3.117 3.097 2.836 2.457 2.665 3.595 
3.313 4.405 4.651 4.057 7.735 8.152 5.584 4.453 6.969 5.720 5.599 6.104 4.814 5.892 8.046 6.745 
5.828 8.020 7.450 6.268 7.944 7.036 5.969 5.059 4.282 3.369 4.325 4.981 6.031 7.236 5.488 4.522 
4.279 5.750 5.304 3.803 5.582 6.227 6.196 5.800 7.536 8.719 8.936 8.818 10.370 9.552 10.138 9.458 
8.566 7.802 7.866 7.964 7.776 8.139 8.071 8.693 8.785 10.909 11.194 12.021 13.793 12.651 12.161 
11.623 9.720 10.190 9.175 8.279 8.448 8.220 7.241 6.170 7.600 7.110 6.548 7.416 8.606 8.006 8.055 
9.674 10.391 8.563 7.591 6.018 7.116 6.656 6.001 6.978 7.962 8.986 10.098 9.376 9.365 8.666 7.613 
7.150 7.040 7.681 6.997 7.127 7.169 8.143 8.104 8.350 9.369 8.551 6.891 8.053 8.821 7.638 6.625 
8.697 8.361 6.656 7.469 8.952 7.664 7.616 9.061 9.245 8.410 9.945 11.829 10.851 10.340 13.135 
11.827 11.837 10.598 11.243 9.954 11.302 12.387 12.946 14.077 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 
15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000
CMA-align_TS2 0.253  8.724 7.584 6.126 4.252 3.961 4.401 3.674 3.220 4.031 5.143 4.491 3.182 3.279 
4.218 4.441 4.075 3.564 3.343 3.220 2.798 2.951 2.845 3.258 3.414 3.497 3.690 3.622 3.570 3.899 
3.774 3.653 3.376 3.120 2.902 2.868 2.704 2.852 3.923 3.942 3.704 3.949 3.077 3.197 2.971 3.350 
3.387 3.626 3.635 4.239 4.107 4.004 4.412 4.670 5.176 4.687 4.650 4.452 4.530 4.027 4.371 5.095 
4.777 4.128 4.309 3.996 3.971 3.925 3.671 3.353 3.144 3.105 3.040 3.145 3.601 3.683 3.549 4.061 
4.521 4.774 4.259 3.694 3.348 3.138 3.261 3.137 3.480 3.740 4.011 4.685 3.758 3.763 3.930 3.813 
3.463 3.590 3.749 3.319 3.124 3.503 3.390 2.983 2.777 3.115 2.947 2.529 2.855 3.040 2.740 2.735 
3.075 3.145 3.108 3.256 3.476 3.620 3.645 3.860 3.960 4.105 4.228 3.929 4.281 3.807 3.514 3.467 
3.635 3.355 3.185 3.362 3.253 3.019 3.177 3.325 2.948 2.881 3.124 3.259 2.729 2.790 3.449 3.499 
3.368 3.588 3.096 3.035 2.797 3.182 3.239 2.935 2.839 3.142 2.947 2.854 3.210 3.425 3.364 3.652 
3.693 3.707 3.566 3.945 3.743 3.316 3.706 3.693 3.365 3.735 3.895 4.031 3.734 3.724 3.572 3.306 
3.570 3.623 3.289 3.276 3.613 3.570 3.400 3.544 3.753 3.742 3.717 3.793 3.751 4.286 3.441 3.238 
3.155 3.165 3.349 3.357 3.409 3.421 3.613 3.290 3.584 4.035 4.190 4.624 4.887 5.070 4.679 4.449 
4.649 4.391 3.893 4.204 4.146 3.787 3.652 3.906 3.872 3.432 3.428 3.742 3.750 3.470 3.721 3.680 
3.472 3.213 3.248 3.328 3.243 3.465 3.782 3.961 4.023 4.148 4.587 4.727 4.214 3.781 3.705 3.257 
3.244 3.054 3.134 3.211 3.444 3.707 4.014 4.264 3.941 3.329 3.681 3.909 3.568 3.369 3.845 3.951 
3.652 3.800 4.021 4.123 3.811 4.124 4.291 4.271 4.149 4.485 4.791 4.716 4.688 4.302 4.266 4.128 
4.347 4.487 4.270 4.193 3.950 3.959 4.123 3.942 4.007 4.453 4.544 4.767 4.762 4.769 5.391 5.520 
5.788 5.870 5.990 6.195 6.523 6.163 5.547 5.765 6.322 6.579 5.602 6.878 6.099 6.111 8.113 10.046 
8.440 10.112 10.312 14.174 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000
IntFOLD5_TS1 0.216  9.749 7.465 6.703 4.214 3.903 3.770 3.269 2.781 3.068 3.844 4.073 3.484 3.778 
4.421 4.411 4.230 4.241 3.600 3.420 3.229 3.401 3.034 3.456 3.552 3.735 3.929 3.881 3.886 4.354 
4.170 3.985 3.684 3.320 3.121 3.064 2.922 2.901 4.150 3.708 3.772 3.792 3.103 3.231 2.997 3.291 
3.617 4.081 4.019 4.709 4.856 4.625 5.239 5.604 6.127 5.631 5.443 5.116 5.288 4.838 4.883 5.146 
5.054 4.625 4.696 4.348 4.383 4.359 4.040 3.870 3.595 3.546 3.570 3.573 4.101 4.232 3.919 4.304 
4.746 4.783 4.672 4.140 3.904 3.608 3.779 3.547 3.985 4.252 4.647 5.360 4.658 4.739 4.725 4.580 
4.052 3.994 4.175 3.803 3.406 3.613 3.721 3.091 3.030 3.456 3.211 2.647 3.105 3.343 2.872 2.894 
3.364 3.356 3.294 3.531 3.934 3.858 3.862 4.112 4.470 4.436 4.637 4.325 4.429 4.131 3.856 3.984 
3.942 3.566 3.486 3.801 3.435 3.227 3.566 3.557 3.083 2.787 3.263 3.489 2.987 2.969 3.584 3.678 
3.499 3.632 3.189 3.282 2.951 2.994 3.047 2.863 2.947 3.110 3.036 3.001 3.317 3.453 3.470 3.748 
3.924 3.978 4.086 4.232 3.943 3.681 4.202 4.207 3.665 4.057 3.930 4.269 4.169 4.267 3.871 3.703 
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15.000 15.000 15.000 15.000 15.000 15.000
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