 
####################################################### 
#                                                     # 
#                        ACE                          # 
#                                                     # 
#        Ab-initio protein structure prediction       # 
#                         &                           # 
#               Comparative modeling                  # 
#                                                     # 
#                     Evaluator                       # 
#                                                     # 
#                ----------------- 11/1998            # 
#                                                     # 
#                         by                          # 
#           Adam Zemla & Ceslovas Venclovas           # 
#                                                     # 
#         Protein Structure Prediction Center         # 
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     # 
#                                                     # 
####################################################### 
########################## 
#                        # 
#    ACE parameters:     # 
#                        # 
########################## 
# 
# MEASURES: 
# 
# For AB: 0 3 9 13 14 
# For CM: 0 1 2 3 6 7 8 9 10 11 12 13 14 18 
# 
ARMSMC  0 1 2     7 8 9    11 12 13 14 18 
ARMSSC  0 1 2 3 6 7 8 9    11 12 13 14 18 
# 
CRMSCA  0 1 2     7 8 9 10 11 12 13 14 18 
CRMSMC  0 1 2     7 8 9 10 11 12 13 14 18 
CRMSSC  0 1 2 3 6     9    11 12 13 14 18 
CRMSALL 0 1 2     7 8 9    11 12 13 14 18 
# 
D-E_CA  0 1 2     7 8 9    11 12 13 14 18 
D-E_MC  0 1 2     7 8 9    11 12 13 14 18 
D-E_SC  0 1 2 3 6 7 8 9    11 12 13 14 18 
D-E_ALL 0 1 2     7 8 9    11 12 13 14 18 
# 
# Output parameters 
# 
DIHED-OUTPUT        0         #    1 - ON, 0 - OFF 
RES-CONTACTS        0         #    1 - ON, 0 - OFF 
SS-OUTPUT           1         #    1 - ON, 0 - OFF 
PHI-PSI             0         #    1 - SEPARATELY, 0 - NO  
# 
# Calculation parameters 
# 
SOV-METHOD          1         #    0 - SOV 94,  1 - SOV 
# 
TEMP-FACTOR         30.0      #    Target structure temperature factor cutoff 
ACCESS-CUTOFF       0.20      #    Solvent accessibility cutoff   
ANGLES-CORRECT      30.0      #    target-model  (diff < 30.0)    
DSSP-HELIX          6         #    Secondary Structure subset: helix cutoff  
DSSP-STRAND         3         #    Secondary Structure subset: strand cutoff 
ROTAMERS-LIMIT      30.0      #    target-parent (diff > 30.0) 
ROTATION-MATRIX     0         #    1 - ON, 0 - OFF   
SC-SWAPPING         1         #    1 - ON, 0 - OFF    
SEP-CONTACTS        1         #    Separation interval along the chain 
RESIDUE-CONTACTS    8.0       #    Contact definition between two C-beta atoms 
# 
CRMS-METHOD         1         #    0 - ALL, 1 - CA, 2 - MC+CB, 3 - CA (iter)  
ITER-CUTOFF         2.5       #    DISTANCE cutoff (for CA (iter))  
LCS_GDT             1         #    LCS and GDT calculations (1 - ON, 0 - OFF) 
########################## 
#                        # 
#      ACE results:      # 
#                        # 
########################## 
 
 
 
# WARNING! The number of residues in SS section: 0 0 , MODEL 0 , TARGET 154 
 
# WARNING! TARGET 1162 atoms, MODEL 154 atoms, 154 common with TARGET 
           Number of atoms possible to evaluate: 154 
 
MEASURES: 
 
 
ANGLES RMS : model <-> target 
 
 (MC: PHI+PSI) DIHED RMS:      ARMSMC            PC     NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0   306     ARMSMC  
     SECONDARY STRUCTURE . .     0.00            0.0     0     0.0   126     ARMSMC  
     SURFACE . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0   178     ARMSMC  
     BURIED  . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0   128     ARMSMC  
 (SC: CHI1) DIHED RMS:         ARMSSC            PC     NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0   130     ARMSSC1 
     RELIABLE SIDE CHAINS  .     0.00            0.0     0     0.0   113     ARMSSC1 
     SECONDARY STRUCTURE . .     0.00            0.0     0     0.0    54     ARMSSC1 
     SURFACE . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    78     ARMSSC1 
     BURIED  . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    52     ARMSSC1 
 (SC: CHI2) DIHED RMS:         ARMSSC            PC     NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    94     ARMSSC2 
     RELIABLE SIDE CHAINS  .     0.00            0.0     0     0.0    70     ARMSSC2 
     SECONDARY STRUCTURE . .     0.00            0.0     0     0.0    39     ARMSSC2 
     SURFACE . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    60     ARMSSC2 
     BURIED  . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    34     ARMSSC2 
 (SC: CHI3) DIHED RMS:         ARMSSC            PC     NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    32     ARMSSC3 
     RELIABLE SIDE CHAINS  .     0.00            0.0     0     0.0    28     ARMSSC3 
     SECONDARY STRUCTURE . .     0.00            0.0     0     0.0    10     ARMSSC3 
     SURFACE . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    32     ARMSSC3 
     BURIED  . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0     0     ARMSSC3 
 (SC: CHI4) DIHED RMS:         ARMSSC            PC     NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    17     ARMSSC4 
     RELIABLE SIDE CHAINS  .     0.00            0.0     0     0.0    17     ARMSSC4 
     SECONDARY STRUCTURE . .     0.00            0.0     0     0.0     6     ARMSSC4 
     SURFACE . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0    17     ARMSSC4 
     BURIED  . . . . . . . .     0.00            0.0     0     0.0     0     ARMSSC4 
 
COORDINATES RMS : model <-> target 
 
 
LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT (Longest continuous sequence under CA RMS cutoff   5.00): 
 FRAGMENT  1    1 - 154  154  Length     Seq        L_RMS   ALL_CA_RMS 
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT   154      1 - 154      3.02     3.02 
  LCS LOCAL_SCORE:            100.00 
 
 
LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT (Longest continuous sequence under CA RMS cutoff   2.00): 
 FRAGMENT  1    1 - 154  154  Length     Seq        L_RMS   ALL_CA_RMS 
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT   127      5 - 131      1.98     3.06 
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT   127      6 - 132      1.99     3.06 
  LCS LOCAL_SCORE:             69.49 
 
 
LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT (Longest continuous sequence under CA RMS cutoff   1.00): 
 FRAGMENT  1    1 - 154  154  Length     Seq        L_RMS   ALL_CA_RMS 
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT    17     76 - 92       0.99     3.91 
  LCS LOCAL_SCORE:              5.87 
 
 
 LCS                   LENGTH_OF_THE 
 LCS  RESIDUE  RESIDUE    CONTINUOUS  SECONDARY 
 LCS   NUMBER     NAME       SEGMENT  STRUCTURE   GDT_DATA_COLUMNS (PERCENT OF THE TARGET) 
 LCS       1       M     0    3  154       -        0   0   1   1   3   8  38  58  68  81  89  94  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS       2       W     0    5  154       -        0   0   2   3   3   5   5  10  29  61  87  94  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS       3       F     4    5  154       -        0   1   2   3   3   3   3   4   4   5   7  16  20  24  38  90  93  96 100 100  
 LCS       4       F     4    5  154       -        0   1   2   3   3   3   3   4   4   5   7   9  10  24  27  49  98  99 100 100  
 LCS       5       N     4  127  154       -        0   1   2   3  21  32  62  78  88  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS       6       K     4  127  154       -        0   2  12  28  57  76  83  89  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS       7       N     4  127  154       -        1   4  25  50  70  80  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS       8       L     4  127  154       -        3  20  41  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS       9       K     4  127  154       -        2  22  40  60  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      10       V     4  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      11       L     5  127  154       -        3  22  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      12       A     9  127  154       -        1   9  35  60  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      13       P     9  127  154       -        2   9  28  50  72  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      14       C     9  127  154       -        3  12  39  57  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      15       D     9  127  154       -        3  13  39  56  72  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      16       G    12  127  154       -        3  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      17       T    12  127  154       -        5  21  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      18       I    12  127  154       -        4  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      19       I    12  127  154       -        4  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      20       T    12  127  154       -        1   7  31  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      21       L    12  127  154       -        3  16  35  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      22       D    12  127  154       -        3  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      23       E    12  127  154       -        5  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      24       V    12  127  154       -        5  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      25       E    12  127  154       -        3  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      26       D    12  127  154       -        3  18  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      27       E    12  127  154       -        3  18  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      28       V    12  127  154       -        3  18  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      29       F    11  127  154       -        4  19  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      30       K    11  127  154       -        3  19  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      31       E    11  127  154       -        1  13  40  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      32       R    11  127  154       -        2   3  27  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      33       M     6  127  154       -        5  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      34       L     6  127  154       -        2   3  11  49  68  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      35       G     6  127  154       -        2   7  30  57  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      36       D     6  127  154       -        2   8  30  57  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      37       G     5  127  154       -        4  20  41  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      38       F     3  127  154       -        1   8  23  51  73  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      39       A     3  127  154       -        5  19  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      40       I    10  127  154       -        3  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      41       N    12  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      42       P    12  127  154       -        2  14  39  59  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      43       K    12  127  154       -        2  12  39  57  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      44       S    12  127  154       -        5  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      45       N    12  127  154       -        3  18  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      46       D    13  127  154       -        5  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      47       F    13  127  154       -        3  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      48       H    13  127  154       -        3  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      49       A    13  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      50       P    13  127  154       -        3  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      51       V    13  127  154       -        5  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      52       S    13  127  154       -        3  17  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      53       G    13  127  154       -        5  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      54       K    13  127  154       -        4  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      55       L    13  127  154       -        4  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      56       V    13  127  154       -        4  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      57       T    13  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      58       A    13  127  154       -        4  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      59       F     4  127  154       -        3   9  33  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      60       P     4  127  154       -        2  10  30  55  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      61       T     4  127  154       -        3  17  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      62       K     4  127  154       -        2   7  25  55  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      63       H     4  127  154       -        3   9  22  43  68  81  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      64       A     4  127  154       -        3  12  40  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      65       F     4  127  154       -        1  11  31  55  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      66       G     5  127  154       -        4  17  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      67       I     7  127  154       -        3  13  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      68       Q     7  127  154       -        1  13  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      69       T     7  127  154       -        1   5  17  42  71  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      70       K     7  127  154       -        1   7  21  48  71  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      71       S     7  127  154       -        1   7  22  52  73  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      72       G     7  127  154       -        2   8  27  59  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      73       V     7  127  154       -        2   8  27  59  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      74       E     7  127  154       -        2   9  38  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      75       I     5  127  154       -        5  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      76       L    17  127  154       -        5  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      77       L    17  127  154       -        5  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      78       H    17  127  154       -        2  12  39  59  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      79       I    17  127  154       -        4  17  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      80       G    17  127  154       -        4  21  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      81       L    17  127  154       -        4  22  42  60  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      82       D    17  127  154       -        3  22  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      83       T    17  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      84       V    17  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      85       S    17  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      86       L    17  127  154       -        3  18  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      87       D    17  127  154       -        3  13  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      88       G    17  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      89       N    17  127  154       -        4  21  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      90       G    17  127  154       -        3  21  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      91       F    17  127  154       -        3  21  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      92       E    17  127  154       -        3  21  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      93       S    16  127  154       -        2  20  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      94       F    16  127  154       -        4  16  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      95       V    16  127  154       -        5  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      96       T    16  127  154       -        7  22  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      97       Q    15  127  154       -        3  22  42  60  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      98       D     7  127  154       -        1   5  27  57  73  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS      99       Q     9  127  154       -        2  12  40  57  73  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     100       E     9  127  154       -        2  17  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     101       V     9  127  154       -        5  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     102       N     9  127  154       -        7  22  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     103       A     9  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     104       G     9  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     105       D     9  127  154       -        3  15  40  60  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     106       K    11  127  154       -        2   8  32  60  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     107       L    11  127  154       -        4  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     108       V    11  127  154       -        4  19  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     109       T    11  127  154       -        3  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     110       V    11  127  154       -        3  15  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     111       D    11  127  154       -        3  11  31  58  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     112       L    11  127  154       -        3  11  40  60  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     113       K    11  127  154       -        3  14  33  60  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     114       S    11  127  154       -        5  18  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     115       V    11  127  154       -        3  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     116       A    11  127  154       -        3  17  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     117       K     4  127  154       -        1   9  29  50  70  81  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     118       K     4  127  154       -        1   6  29  51  70  81  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     119       V     7  127  154       -        1  22  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     120       P     7  127  154       -        5  22  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     121       S     7  127  154       -        2  19  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     122       I     7  127  154       -        3  22  42  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     123       K     7  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     124       S     7  127  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     125       P     7  127  154       -        5  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     126       I     6  127  154       -        5  20  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     127       I     4  127  154       -        1   8  37  60  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     128       F     4  127  154       -        1   4  14  38  62  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     129       T     4  127  154       -        1  18  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     130       N     4  127  154       -        2  13  39  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     131       N     4  127  154       -        1   2  13  40  67  81  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     132       G     4  127  154       -        1   2   3   7  15  46  68  83  90  91  93  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     133       G     5   10  154       -        1   2   4  12  18  25  35  42  76  87  92  94  96  97  98  98  98  99 100 100  
 LCS     134       K     5    7  154       -        0   8  22  43  60  78  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     135       T     5    7  154       -        2  19  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     136       L     5    7  154       -        2   3  12  48  72  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     137       E     5    7  154       -        2   2   3   3  35  68  81  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     138       I     4   10  154       -        2  11  24  54  71  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     139       V     4   10  154       -        5  18  41  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     140       K     4   11  154       -        1  15  39  57  73  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     141       M     6   11  154       -        2   7  15  42  68  81  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     142       G     6   11  154       -        3  14  37  51  70  81  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     143       E     6   11  154       -        2  13  37  51  68  81  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     144       V     6   11  154       -        4  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     145       K     6   11  154       -        7  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     146       Q     6   11  154       -        3  22  43  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     147       G     6   11  154       -        3  10  35  61  74  82  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     148       D     4   11  154       -        1   5  18  36  63  79  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     149       V     4   11  154       -        1   3  25  47  68  79  87  90  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     150       V     4   11  154       -        1   5  10  16  34  60  75  88  90  92  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     151       A     4   11  154       -        1   8  16  26  50  69  83  88  92  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     152       I     4    6  154       -        1   2  10  14  24  51  61  83  90  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     153       L     3    6  154       -        1   3   9  14  24  29  55  81  90  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS     154       K     3    5  154       -        1   6  10  15  24  43  72  85  90  95  96  96  97  98  98  98  98  99 100 100  
 LCS TOTAL_SCORE (RMS CUTOFF   1.00):   5.87 
 
 NUMBER_OF_CA_Tg:  154      NUMBER_OF_CA_Pr:  154      PERCENT_OF_CA: 100.00  
 
GLOBAL_DISTANCE_TEST (the largest set of residues under DISTANCE_CUTOFF (using LCS results)): 
 GDT DISTANCE_CUTOFF     0.50    1.00    1.50    2.00    2.50    3.00    3.50    4.00    4.50    5.00    5.50    6.00    6.50    7.00    7.50    8.00    8.50    9.00    9.50   10.00  
 GDT NUMBER_OF_CA_max      12      34      67      94     115     127     135     140     142     147     148     149     150     151     152     152     152     153     154     154  
 GDT PERCENT_OF_CA_Pr    7.79   22.08   43.51   61.04   74.68   82.47   87.66   90.91   92.21   95.45   96.10   96.75   97.40   98.05   98.70   98.70   98.70   99.35  100.00  100.00 
 GDT PERCENT_OF_CA_Tg    7.79   22.08   43.51   61.04   74.68   82.47   87.66   90.91   92.21   95.45   96.10   96.75   97.40   98.05   98.70   98.70   98.70   99.35  100.00  100.00 
 GDT FRAGMENT: Beg-End  10-145   9-145  10-146   8-147   8-147   8-147   8-147   7-149   6-149   5-154   5-154   5-154   1-154   1-154   1-154   1-154   1-154   1-154   1-154   1-154 
 GDT RMS_LOCAL           0.38    0.73    1.14    1.39    1.60    1.77    1.89    2.01    2.07    2.31    2.35    2.41    2.51    2.62    2.70    2.70    2.70    2.85    3.02    3.02 
 GDT RMS_ALL_CA          3.47    3.55    3.08    3.06    3.07    3.07    3.08    3.07    3.06    3.06    3.06    3.05    3.04    3.03    3.03    3.03    3.03    3.03    3.02    3.02 
 
 
 TEST (CA)  RMS =   3.02               (Number of atoms:  154) 
 
 (CA)  RMS:                   CRMSCA         NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    3.02        154   100.0   154     CRMSCA  
     CRN = ALL/NP  . . . . .    0.0196                            CRMSCA  
     SECONDARY STRUCTURE . .    2.33         63   100.0    63     CRMSCA  
     SURFACE . . . . . . . .    3.47         90   100.0    90     CRMSCA  
     BURIED  . . . . . . . .    2.25         64   100.0    64     CRMSCA  
 (MC)  RMS:                   CRMSMC         NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    3.02        154    20.4   756     CRMSMC  
     SECONDARY STRUCTURE . .    2.33         63    20.3   310     CRMSMC  
     SURFACE . . . . . . . .    3.47         90    20.4   442     CRMSMC  
     BURIED  . . . . . . . .    2.25         64    20.4   314     CRMSMC  
 (SC)  RMS:                   CRMSSC         NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    0.00          0     0.0   546     CRMSSC  
     RELIABLE SIDE CHAINS  .    0.00          0     0.0   450     CRMSSC  
     SECONDARY STRUCTURE . .    0.00          0     0.0   229     CRMSSC  
     SURFACE . . . . . . . .    0.00          0     0.0   333     CRMSSC  
     BURIED  . . . . . . . .    0.00          0     0.0   213     CRMSSC  
 (ALL) RMS:                   CRMSALL        NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    3.02        154    13.3  1162     CRMSALL 
     SECONDARY STRUCTURE . .    2.33         63    13.1   481     CRMSALL 
     SURFACE . . . . . . . .    3.47         90    13.0   693     CRMSALL 
     BURIED  . . . . . . . .    2.25         64    13.6   469     CRMSALL 
 
Accuracy of estimates of atomic coordinate errors: model <-> target 
 
 (CA)  ERRORS:                  |D-E|   |D-E|/|D+E|   SR(D,E)    NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    1.807      0.641       0.321    154   100.0   154     ERRCA  
     SECONDARY STRUCTURE . .    1.643      0.669       0.335     63   100.0    63     ERRCA  
     SURFACE . . . . . . . .    1.960      0.621       0.310     90   100.0    90     ERRCA  
     BURIED  . . . . . . . .    1.592      0.670       0.335     64   100.0    64     ERRCA  
 (MC)  ERRORS:                  |D-E|   |D-E|/|D+E|   SR(D,E)    NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    1.807      0.641       0.321    154    20.4   756     ERRMC  
     SECONDARY STRUCTURE . .    1.643      0.669       0.335     63    20.3   310     ERRMC  
     SURFACE . . . . . . . .    1.960      0.621       0.310     90    20.4   442     ERRMC  
     BURIED  . . . . . . . .    1.592      0.670       0.335     64    20.4   314     ERRMC  
 (SC)  ERRORS:                  |D-E|   |D-E|/|D+E|   SR(D,E)    NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    0.000      0.000       0.000      0     0.0   546     ERRSC  
     RELIABLE SIDE CHAINS  .    0.000      0.000       0.000      0     0.0   450     ERRSC  
     SECONDARY STRUCTURE . .    0.000      0.000       0.000      0     0.0   229     ERRSC  
     SURFACE . . . . . . . .    0.000      0.000       0.000      0     0.0   333     ERRSC  
     BURIED  . . . . . . . .    0.000      0.000       0.000      0     0.0   213     ERRSC  
 (ALL) ERRORS:                  |D-E|   |D-E|/|D+E|   SR(D,E)    NP     PP     TN 
     ALL . . . . . . . . . .    1.807      0.641       0.321    154    13.3  1162     ERRALL 
     SECONDARY STRUCTURE . .    1.643      0.669       0.335     63    13.1   481     ERRALL 
     SURFACE . . . . . . . .    1.960      0.621       0.310     90    13.0   693     ERRALL 
     BURIED  . . . . . . . .    1.592      0.670       0.335     64    13.6   469     ERRALL 
 
 
 
DISTANCES: Percent of total atoms where distance (target <-> model) in global 
           superposition is less than: 1 , 2 , 3 , 5 , 10 Angstroms 
            D < 1     D < 2     D < 3     D < 5    D < 10      NP      TN 
CA  (N)        22        85       121       142       152     154     154   DISTCA 
CA  (P)     14.29     55.19     78.57     92.21     98.70             154   DISTCA 
CA  (RMS)    0.74      1.35      1.74      2.13      2.71                   DISTCA 
 
ALL (N)        22        85       121       142       152     154    1162   DISTALL 
ALL (P)      1.89      7.31     10.41     12.22     13.08            1162   DISTALL 
ALL (RMS)    0.74      1.35      1.74      2.13      2.71                   DISTALL 
 
 
 
 
END of the results output 
